Pathogène

Un pathogène est tout micro-organisme ou parasite capable de provoquer une maladie chez un hôte — en aquaculture, un spectre allant des tueurs obligatoires tels que les virus (qui peuvent dévaster même des stocks bien gérés et non stressés) aux bactéries opportunistes comme Aeromonas, Vibrio et Pseudomonas, qui existent normalement à des niveaux de fond inoffensifs et ne causent des maladies que lorsque les défenses de l'hôte sont affaiblies. La survenue réelle d'une maladie est le produit de l'interaction entre la charge pathogène, la susceptibilité de l'hôte et les conditions environnementales — la triade épidémiologique classique — c'est pourquoi les épidémies en aquaculture sont généralement le symptôme visible d'une défaillance de la qualité de l'eau, de la densité ou de la manipulation, plutôt qu'un malheur aléatoire. Les facteurs de stress, notamment la surpopulation, l'hypoxie, l'exposition à l'ammoniac, les changements rapides de température et la manipulation, élèvent tous le cortisol et suppriment la fonction immunitaire, faisant pencher la balance vers des organismes auxquels les poissons résisteraient autrement. Les pathogènes se propagent par l'eau, les équipements contaminés, les aliments vivants et le mouvement des stocks entre les fermes, c'est pourquoi la quarantaine, la désinfection et la gestion par lots tout-en-un-tout-sortant sont les outils de biosécurité fondamentaux de l'industrie. La surveillance moderne repose sur les diagnostics moléculaires — des tests qPCR et RT-PCR qui détectent l'ADN ou l'ARN pathogène à de très faibles concentrations — permettant une détection précoce chez les géniteurs apparemment sains et des programmes de certification tels que SPF avant l'apparition de la maladie clinique.