Izin Pembuangan Air dan Batas Efluen
Izin pembuangan air mengizinkan suatu peternakan untuk melepaskan efluen ke perairan penerima dan menentukan batas kualitas yang harus dipenuhi oleh pembuangan tersebut. Regulator mengeluarkan izin yang mencakup parameter seperti total padatan tersuspensi (biasanya dibatasi hingga puluhan mg/L di atas tingkat masukan), kebutuhan oksigen biokimia, fosfor dan nitrogen terlarut, serta pembuangan padatan yang dapat mengendap dari aktivitas peternakan. Peternakan ikan trout sistem aliran, misalnya, sering menghadapi batas sekitar 25 hingga 30 mg/L TSS dan 5 hingga 10 mg/L BOD5 pada saluran pembuangan, sementara peternakan keramba diatur melalui pemantauan bentik sedimen di bawah peternakan, dengan ambang batas sulfida sekitar 1.500 umol/L yang menandakan pengayaan yang tidak dapat diterima. Izin menentukan frekuensi pemantauan, titik pengambilan sampel, dan kewajiban pelaporan; melebihi batas dapat mengakibatkan denda, pengurangan biomassa paksa, atau penangguhan izin. Oleh karena itu, peternakan memperlakukan kontrol efluen sebagai parameter desain: kolam sedimentasi dan filtrasi drum sebelum pembuangan, pengurangan limbah pakan melalui kualitas pelet yang lebih baik, dan pengosongan antara siklus semuanya mengurangi risiko kepatuhan. Di wilayah padat akuakultur, batas kumulatif tingkat cekungan menggantikan batas individu, menghubungkan anggaran pembuangan setiap peternakan dengan kapasitas asimilasi badan air bersama.