細菌培養および分離（診断ラボ）

培養ベースの細菌診断では、臨床サンプル（血液、病変スワブ、内臓組織など）を、疑われる病原体の増殖を促進しつつ競合する背景細菌を抑制するように調合された選択培地および鑑別培地で培養し、個々のコロニーを分離して同定します。そして、重要なこととして、PCRが病原体の遺伝的同一性を確認するだけで、生きた生物が実際にどの治療法に反応するかについては何も示さないため、qPCRのような分子生物学的手法では提供できない抗菌薬感受性試験を行います。このプロセスはPCRベースの診断よりも大幅に時間がかかり、通常、生物の増殖速度に応じて24〜72時間以上かかります。これが、さらなる特性評価と治療指針のための生きた分離株を生成するという独自の能力と比較した場合の主な実用上の欠点です。分離されたコロニーの同定は、従来、生化学的検査パネル（細菌の属と種を区別する一連の代謝反応）に依存していましたが、MALDI-TOF質量分析法や分離株の部分的な遺伝子配列決定などの迅速な方法が、より迅速で正確な種確認のためにますます使用されています。特に水産養殖の健康管理においては、臨床的疑いのみで広域スペクトル抗菌薬を適用するのではなく、抗菌薬感受性結果を伴う確認された培養が、適切な治療法を選択するためのゴールドスタンダードな根拠となります。この区別は、抗菌薬耐性管理に直接関係します。