การขอใบอนุญาตใช้น้ำบาดาลสำหรับโรงเพาะฟักและระบบหมุนเวียนน้ำ (RAS)

การสูบน้ำบาดาลเพื่อใช้เป็นน้ำเข้าสำหรับโรงเพาะฟักหรือระบบ RAS มีการควบคุมแยกต่างหากจากการสูบน้ำผิวดินในเขตอำนาจศาลส่วนใหญ่ โดยทั่วไปมักจะต้องมีใบอนุญาตเฉพาะที่ครอบคลุมถึงปริมาณน้ำที่ยั่งยืน (sustainable yield) ว่าสามารถสูบน้ำออกจากชั้นหินอุ้มน้ำเฉพาะแห่งได้มากเพียงใดโดยไม่ก่อให้เกิดการลดลงของระดับน้ำในระยะยาว หรือส่งผลกระทบต่อบ่ออื่นๆ และแหล่งน้ำผิวดินที่พึ่งพาอาศัยระบบนิเวศซึ่งใช้น้ำจากชั้นหินอุ้มน้ำเดียวกัน ซึ่งการประเมินนี้ถือเป็นการประเมินอุทกธรณีวิทยาที่แตกต่างจากการคำนวณตามอัตราการไหลที่ใช้ในการขออนุญาตน้ำผิวดิน ลักษณะเฉพาะของชั้นหินอุ้มน้ำ อัตราการเติมน้ำใต้ดิน ความจุในการกักเก็บ และความเชื่อมโยงกับแหล่งน้ำผิวดินหรือบ่ออื่นๆ เป็นตัวกำหนดว่าแหล่งน้ำบาดาลนั้นๆ จะสามารถรองรับการสูบน้ำอย่างต่อเนื่องได้จริงมากแค่ไหนโดยไม่เกิดความแห้งเหือด ซึ่งหมายความว่าขีดจำกัดปริมาณน้ำตามใบอนุญาตสำหรับน้ำบาดาลมักจะมีรากฐานมาจากแบบจำลองอุทกธรณีวิทยาเฉพาะของชั้นหินอุ้มน้ำเป้าหมาย มากกว่าการกำหนดโควตาปริมาณน้ำแบบทั่วไปที่ใช้เหมือนกันหมดโดยไม่คำนึงถึงลักษณะและสภาพที่แท้จริงของชั้นหินอุ้มน้ำนั้นๆ ปัญหาการรบกวนบ่อข้างเคียง ซึ่งเกิดจากการสูบน้ำปริมาณมากเพื่อการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำแห่งใหม่ทำให้ระดับน้ำใต้ดินลดลงมากพอที่จะส่งผลกระทบต่อบ่ออุปโภคบริโภค บ่อเกษตรกรรม หรือบ่ออื่นๆ ที่มีอยู่เดิมซึ่งใช้น้ำจากชั้นหินอุ้มน้ำเดียวกัน ถือเป็นสาเหตุทั่วไปของการคัดค้านและข้อพิพาทในการขอใบอนุญาต และกรอบการออกใบอนุญาตน้ำบาดาลหลายแห่งกำหนดให้ต้องมีการวิเคราะห์การรบกวน (interference analysis) เพื่อแสดงให้เห็นว่าการสูบน้ำใหม่ที่เสนอจะไม่ส่งผลกระทบอย่างไม่สมเหตุสมผลต่อผู้ใช้เดิมที่ได้รับอนุญาตไปแล้ว ก่อนที่จะอนุมัติใบอนุญาตใหม่ นอกจากนี้ คุณภาพน้ำบาดาลสำหรับการใช้งานในโรงเพาะฟักมักจะต้องมีการตรวจสอบคุณลักษณะเฉพาะของตนเองแยกต่างหากจากกระบวนการขออนุญาตด้านปริมาณน้ำ เนื่องจากเคมีของน้ำบาดาล ปริมาณก๊าซที่ละลายน้ำ ระดับเหล็กและแมงกานีส และในพื้นที่ชายฝั่งมีความเสี่ยงเรื่องการรุกตัวของน้ำเค็ม ซึ่งอาจมีความแตกต่างกันอย่างมากแม้กระทั่งในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ขนาดเล็ก และส่งผลโดยตรงต่อความเหมาะสมของบ่อบาดาลเฉพาะแห่งในการนำมาใช้กับโรงเพาะฟักที่อ่อนไหว โดยไม่คำนึงว่าจะมีปริมาณน้ำที่ได้รับอนุญาตเพียงพอหรือไม่ก็ตาม