تحديد مواقع الصفات الكمية (QTL)

يحدد تحديد مواقع الصفات الكمية (QTL) مناطق محددة من الجينوم مرتبطة إحصائيًا بالتباين في صفة كمية، وهي صفة تُقاس على مقياس رقمي مستمر مثل معدل النمو أو وزن الجسم بدلاً من خاصية بسيطة موجودة أو غائبة، وذلك عن طريق تتبع كيفية تباين القيمة المقاسة للصفة مع أنماط الواسمات الجينية الموروثة عبر عائلة أو تجمع سكاني منظم. هذه تقنية رسم خرائط جينية أساسية سبقت ومهدت الطريق المنهجي الذي بُني عليه لاحقًا من خلال دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) باستخدام تغطية واسمات أكثر كثافة على مستوى الجينوم. استخدم تحديد مواقع الصفات الكمية التقليدي عادةً عددًا أقل من الواسمات الجينية عبر تهجين تربية مصمم خصيصًا، مما يوفر دقة جينومية أقل، ويحدد فقط منطقة كروموسومية واسعة من المحتمل أن تحتوي على الجين المسبب بدلاً من تحديده بدقة، مقارنة بما يمكن أن تحققه مناهج GWAS الحديثة ذات الواسمات الكثيفة، مما يعني أن نتائج تحديد مواقع الصفات الكمية غالبًا ما تتطلب عملًا إضافيًا كبيرًا لتحديد المواقع بدقة للانتقال من منطقة واسعة محددة إلى جين مرشح فعلي أو متغير سببي دقيق. على الرغم من أن الأدوات الجينومية الحديثة الأكثر كثافة قد حلت إلى حد كبير محل تحديد مواقع الصفات الكمية التقليدي كطريقة اكتشاف أساسية لارتباطات الصفات الجديدة في برامج التربية ذات الموارد الجيدة، إلا أن إطار عمل تحديد مواقع الصفات الكمية ومنطقه الإحصائي الأساسي يظلان أساسيين من الناحية المفاهيمية لفهم البنية الجينية، وعدد المناطق الجينومية التي تؤثر على صفة معينة وحجم التأثير الفردي لكل منطقة، وهي معلومات تشكل مباشرة ما إذا كانت الصفة مرشحًا جيدًا للاختيار الموجه بمساعدة الواسمات باستخدام واسم واحد أو عدد قليل من الواسمات ذات التأثير الكبير مقابل الحاجة إلى مناهج اختيار جينومية أوسع تناسب بشكل أفضل الصفات المتأثرة بالعديد من المناطق الجينومية ذات التأثير الصغير. تم تنقيح والتحقق من العديد من مناطق QTL التي تم تحديدها تاريخيًا لصفات الاستزراع المائي الهامة، مثل مقاومة الأمراض والنمو، باستخدام مناهج GWAS الحديثة وتحديد المواقع بدقة، مما يعني أن لوحات الواسمات لبرامج التربية الحالية غالبًا ما تتضمن نتائج تعود أصول اكتشافها إلى عقود من أبحاث تحديد مواقع الصفات الكمية المتراكمة حتى عندما تكون تقنية التحديد المحددة نفسها قد تم تجاوزها.