দ্রাক্ষাফল

একটি রেফারেন্স জিনোম অ্যাসেম্বলি হল একটি প্রজাতির ডিএনএ-এর সম্পূর্ণ, পর্যায়ক্রমিক ক্রম, যা এক বা একাধিক প্রতিনিধিত্বমূলক ব্যক্তির জিনোমের সিকোয়েন্সিং এবং কম্পিউটেশনাল পুনর্গঠন থেকে তৈরি করা হয়, যা ভিত্তি মানচিত্র হিসেবে কাজ করে যাতে সমস্ত পরবর্তী জেনেটিক মার্কার কাজ, SNP অ্যারে ডিজাইন, GWAS বিশ্লেষণ, বৈচিত্র্য শনাক্তকরণ সেই প্রজাতির জন্য সংযুক্ত এবং ব্যাখ্যা করা হয়, অর্থাৎ একটি প্রজাতির রেফারেন্স জিনোমের মান সরাসরি এটি ব্যবহার করে তৈরি করা মৌলিকভাবে প্রতিটি পরবর্তী জেনোমিক টুলের রেজোলিউশন এবং বিশ্বাসযোগ্যতাকে সীমিত করে। অ্যাসেম্বলি মানকে পরিমাপ করা হয় সম্পূর্ণতা দ্বারা, অর্থাৎ কতটুকু প্রকৃত জিনোম হচ্ছে ফাঁক ছাড়া উপস্থাপিত, এবং সংযুক্ততার দ্বারা, অর্থাৎ গ্যাপ বা বিরতি ঘটার আগে আসেম্বল করা ক্রম ক্রমিকার টুকরোর দৈর্ঘ্য কত, যেখানে আধুনিক দীর্ঘ-পাঠ সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি পুরনো শুধুমাত্র ছোট-পাঠ পদ্ধতির তুলনায় অর্জনযোগ্য অ্যাসেম্বলি মান উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করেছে, যা জটিল জিনোমের জন্য সাধারণত আরও টুকরো টুকরো, কম সংযুক্ত অ্যাসেম্বলি তৈরি করত। প্রধান চাষকৃত মাছ এবং চিংড়ি প্রজাতিগুলোর এখন সাধারণভাবে যথেষ্ট উচ্চ-মানের প্রকাশিত রেফারেন্স জিনোম পাবলিক বৈজ্ঞানিক ডাটাবেসের মাধ্যমে উপলব্ধ, যা একটি ভিত্তিমূলক সম্পদ হিসেবে কাজ করে এবং গত দশকে জলজ কৃষি খাতে জিনোমিক সিলেকশন এবং মার্কার-সহায়িত প্রজননকে বিস্তৃতভাবে সম্প্রসারণে সরাসরি সহায়তা করেছে, যখন কিছু কম বাণিজ্যিকভাবে উন্নত বা সম্প্রতি গৃহায়িত প্রজাতি এখনও তুলনামূলকভাবে পরিপক্ব রেফারেন্স অ্যাসেম্বলির অভাব রয়েছে, যা সেই প্রজাতিগুলোর জন্য বর্তমানে কতটা উন্নত জিনোমিক প্রজনন সরঞ্জাম তৈরি করা যেতে পারে তা সীমিত করে। জিনোম অ্যানোটেশন হল, কোন অংশগুলি আসলাম্বেল করা ক্রমের সাথে প্রকৃত জিনগুলির মিল খায় এবং সেই জিনগুলির সম্ভাব্য জৈবিক কার্যকারিতা কী, তা সনাক্ত করা; এটি একটি পৃথক কিন্তু ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত উদ্যোগ যা সম্পূর্ণ অ্যালাসেম্বলি-এর উপর ভিত্তি করে নির্মিত, এবং অ্যানোটেশনের মানও একইভাবে প্রভাব ফেলে যে কোনও GWAS বা অন্যান্য জিনোমিক ফলাফল কতটা ব্যাখ্যাযোগ্য, কারণ একটি ভালোভাবে অ্যানোটেড জিনোম গবেষকদেরকে একটি পরিসংখ্যানগতভাবে যুক্ত জিনোমিক অঞ্চলের সঙ্গে একটি নির্দিষ্ট, জৈবভাবে সম্ভাব্য প্রার্থী জিনের সংযোগ স্থাপন করতে দেয়, পরিবর্তে ফলাফলটিকে একটি অনুযোগযোগ্য পরিসংখ্যানগত সংকেত হিসাবে না রেখে যার কোনও স্পষ্ট জৈবিক ব্যাখ্যা নেই।