সমগ্র Giamoice অ্যাপ্লিকেশন (বারুদস্টক)
সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি ব্যক্তির সম্পূর্ণ জেনেটিক সিকোয়েন্স পড়ে, শুধুমাত্র মার্কার অবস্থানের একটি নির্বাচিত উপসেট নয়, যা একটি নির্দিষ্ট ব্যক্তির জন্য সবচেয়ে সম্পূর্ণ সম্ভাব্য জিনোমিক তথ্য প্রদান করে, তবে প্রতি নমুনার খরচ SNP অ্যারে বা জিনোটাইপিং-বাই-সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি হয়, এই কারণেই বাণিজ্যিক জলজ-পালন প্রজনন প্রোগ্রামে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং সাধারণত নির্বাচিতভাবে প্রয়োগ করা হয় কিছু বিশেষভাবে মূল্যবান মূল প্রজনন বা রেফারেন্স ব্যক্তিদের ক্ষেত্রে, বরং প্রতিটি প্রজন্মে পুরো প্রার্থী প্রজনন জনগোষ্ঠীর নিয়মিত জিনোটাইপিংয়ের জন্য ব্যবহার করা হয় না। একটি প্রধান ব্যবহারিক প্রয়োগ হচ্ছে প্রতিনিধি রেফারেন্স সেটের ব্যক্তিদের থেকে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং ডেটা ব্যবহার করে নতুন জেনেটিক মার্কার আবিষ্কার এবং চরিত্রায়ন করা, যা সরাসরি পরবর্তী অ্যারে ডিজাইন বা ভেরিয়েন্ট কলিং রেফারেন্স প্যানেলগুলিতে প্রয়োগ করা হয় যা বৃহত্তর প্রজনন জনগোষ্ঠীর আরও খরচ-প্রभावী রুটিন জেনোটাইপিংয়ের জন্য ব্যবহৃত হয়, অর্থাৎ সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং প্রায়ই একটি ভিত্তি আবিষ্কারের স্তর হিসাবে কাজ করে যা সস্তা, আরও স্কেলযোগ্য পরবর্তী জেনোটাইপিং সরঞ্জামকে সহায়তা করে, বরং বেশিরভাগ কার্যকরী প্রজনন প্রোগ্রামগুলিতে এটি স্বয়ংক্রিয়ভাবে প্রতিটি ব্যক্তির জেনোটাইপিং পদ্ধতি হিসাবে ব্যবহৃত হয় না। দূর্লভ, বড় প্রভাবের জেনেটিক ভেরিয়্যান্ট সনাক্ত করা, যার মধ্যে নির্দিষ্ট রোগ-প্রতিরোধকারী মিউটেশন বা ক্ষতিকর রিসেসিভ ভেরিয়্যান্ট রয়েছে যা উভয় পিতামাতা থেকে দ্বিগুণ কপিতে উত্তরাধিকার সূত্রে প্রাপ্ত হলে সমস্যা সৃষ্টি করতে পারে, বিশেষভাবে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং প্রদত্ত ব্যাপক কাভারেজ থেকে লাভবান হয়, কারণ কম-ঘনত্বের জেনোটাইপিং অ্যারে যা বিশেষ ভেরিয়্যান্টের জিনোমিক অবস্থানের নিকটে মার্কার অন্তর্ভুক্ত করে না, তা থেকে দূর্লভ, গুরুত্বপূর্ণ ভেরিয়্যান্ট সম্পূর্ণভাবে মিস হতে পারে। যেহেতু সিকোয়েন্সিং খরচ সমগ্র জিনোমিক্স শিল্পে দীর্ঘমেয়াদী হ্রাস অব্যাহত রেখেছে, সারা জিনোম সিকোয়েন্সিং ধীরে ধীরে একমাত্র গবেষণামূলক সরঞ্জাম থেকে সবচেয়ে উন্নত, সম্পদসমৃদ্ধ বাণিজ্যিক জলজ শস্য পদ্ধতিতে ব্যবহারিক প্রয়োগের দিকে বিস্তৃত হয়েছে, যদিও এটি আপাতত আরও নির্বাচনী ও কৌশলগতভাবে ব্যবহার করা হয় এমন একটি সরঞ্জাম হিসাবে রয়ে গেছে, দৈনন্দিন নির্বাচন সিদ্ধান্তের জন্য বেশিরভাগ ব্রীডিং প্রোগ্রাম বর্তমানে নির্ভরশীল সাধারণ, জনগণ-ব্যাপী জিনোটাইপিং পদ্ধতির পরিবর্তে।