Genomische Geschätzte Zuchtwerte (GEBV) und ssGBLUP
Ein genomischer geschätzter Zuchtwert (GEBV) prognostiziert den genetischen Wert eines Individuums für ein Merkmal, indem er dessen dichtes genetisches Markerprofil mit den Merkmals- und Markerdaten einer größeren Referenzpopulation von Verwandten kombiniert. Dies führt zu einer erheblich genaueren Vorhersage als eine, die allein auf Abstammungs- und Phänotypdaten basiert. Dies ist besonders wertvoll für Merkmale wie Krankheitsresistenz oder Schlachtkörperqualität, die nur durch das Schlachten des Tieres oder dessen Exposition gegenüber einer Krankheitsherausforderung gemessen werden können. Das bedeutet, dass das eigentliche Zuchttier selbst niemals direkt für dieses spezifische Merkmal phänotypisiert werden kann, aber sein genomisches Profil ermöglicht es Züchtern dennoch, seinen wahrscheinlichen genetischen Wert auf der Grundlage der Leistung seiner spezifischen genetischen Marker bei gemessenen Verwandten abzuschätzen. Single-step genomic BLUP (ssGBLUP) ist die heute standardmäßige statistische Methode, die genomische Markerdaten, Abstammungsbeziehungsdaten und phänotypische Aufzeichnungen in einem einzigen analytischen Schritt zu einem vereinheitlichten Vorhersagemodell kombiniert. Sie ersetzt ältere mehrstufige Ansätze, die diese verschiedenen Datenquellen weniger effizient und mit größerer Möglichkeit für Informationsverlust oder Inkonsistenz zwischen den Schritten kombinierten. Die Vorhersagegenauigkeit hängt stark von der Größe und Relevanz der zur Kalibrierung des Modells verwendeten Referenzpopulation ab, da eine genomische Vorhersage nur so gut ist wie die Repräsentativität und Größe der zugrunde liegenden Trainingsdaten, die genetische Marker mit tatsächlichen Merkmalsergebnissen verbinden. Dies bedeutet, dass Zuchtprogramme ihre Referenzpopulation kontinuierlich mit den Phänotyp- und Genotypdaten jeder neuen Generation aktualisieren und erweitern, um die Vorhersagegenauigkeit über aufeinanderfolgende Zuchtzyklen hinweg aufrechtzuerhalten und zu verbessern, anstatt sich auf eine statische Referenzpopulation zu verlassen, die einmal früh in der Geschichte des Programms etabliert wurde. Die Auswahl von Zuchtkandidaten auf der Grundlage von GEBV anstelle von allein auf Abstammung basierenden geschätzten Zuchtwerten hat die Rate des genetischen Fortschritts in mehreren großen Aquakultur-Zuchtprogrammen messbar beschleunigt, da genomische Informationen es Züchtern ermöglichen, genauere Selektionsentscheidungen früher im Leben eines Tieres zu treffen, bevor die volle phänotypische Leistung beobachtbar ist, wodurch das Generationsintervall verkürzt wird, das zur Erzielung eines bestimmten Niveaus genetischer Verbesserung erforderlich ist.
