מקורות שומן חלופיים (שמני אצות ושמרים)
מעבר לשמן אצות המעובד ומשווק במיוחד בשל תכולת אומגה-3 שבו, קטגוריה רחבה יותר של מקורות שומן מיקרוביאליים, כולל זני שמרים אולאגינוזיים מסוימים שהונדסו או נבחרו לצבור תכולת שומן גבוהה כאשר הם מותססים על מצעי פחמן שונים, מציעה למפתחי פורמולות למזון ימי אפשרויות שומן נוספות הנבדלות הן משמן דגים קונבנציונלי והן משמנים צמחיים, כאשר כל אחד מהם נושא פרופיל חומצות שומן שונה הקובע את התאמתו התזונתית הספציפית למין נתון ולמטרת הפורמולציה. שמנים שמקורם בשמרים מכילים בדרך כלל סוגי חומצות שומן שונים מאשר שמני אצות ימיים, ובדרך כלל חסרה בהם אותה תכולת אומגה-3 ארוכת שרשרת שהופכת את שמן האצות לבעל ערך במיוחד כתחליף שמן דגים בתזונה של טורפים ימיים. משמעות הדבר היא ששמני שמרים ממוקמים בדרך כלל כמקור שומן כללי עשיר באנרגיה או בשל חומצות השומן הספציפיות שלהם או תכונות פונקציונליות אחרות, ולא כתחליף ישיר לאומגה-3 המתחרה באותו תפקיד פורמולציה כמו שמן אצות. ייצור שומנים מבוסס תסיסה חולק חלק ניכר מאותה תשתית ביו-תהליכית בסיסית וכלכלת עלויות חומרי גלם כמו ייצור חלבון מבוסס תסיסה, כלומר חברות ומתקנים המפתחים מקורות שומן מיקרוביאליים פועלים לעיתים קרובות באותה מערכת אקולוגית רחבה יותר של תסיסה מדויקת וביוטכנולוגיה תעשייתית, ולא כסקטור ייצור נפרד לחלוטין ובלתי קשור. אסטרטגיות ערבוב המשלבות מספר מקורות שומן חלופיים, ושימור חלקי של שמן דגים קונבנציונלי במיוחד עבור תכולת אומגה-3 ארוכת השרשרת שנותרת הקשה ביותר להחלפה מלאה ממקורות לא ימיים בעלות דומה, מייצגות את הגישה המסחרית הנפוצה יותר לטווח הקצר ברוב פורמולות המזון הימיות והסלמונידיות בעלות הביצועים הגבוהים, ולא החלפה מלאה וסיטונאית של מקור שומן חלופי יחיד כלשהו עבור כל השומן התזונתי.