जलीय कृषि में जीनोम-व्यापी साहचर्य अध्ययन (GWAS)

एक जीनोम-व्यापी साहचर्य अध्ययन (GWAS) सांख्यिकीय रूप से यह परीक्षण करता है कि जीनोम में विशिष्ट आनुवंशिक मार्कर स्थितियाँ जीनोटाइप किए गए और फेनोटाइप किए गए व्यक्तियों की आबादी में मापे गए लक्षण, जैसे रोग प्रतिरोधक क्षमता, विकास दर, तनाव सहिष्णुता में भिन्नता के साथ सहसंबंधित हैं या नहीं। यह उन विशिष्ट जीनोमिक क्षेत्रों की पहचान करता है जो वास्तव में उस लक्षण से जुड़े हैं, बजाय इसके कि यह मान लिया जाए कि लक्षण भिन्नता पूरे जीनोम में समान रूप से वितरित है और इसकी कोई पहचान योग्य आनुवंशिक वास्तुकला नहीं है। जलीय कृषि प्रजातियों के लिए, GWAS रोग प्रतिरोधक क्षमता लक्षणों के मानचित्रण के लिए विशेष रूप से मूल्यवान रहा है, क्योंकि प्रमुख खेती की जाने वाली प्रजातियों में कई आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण बीमारियों के लिए बड़े प्रभाव वाले एक एकल जीनोमिक क्षेत्र की पहचान की गई है, जो लक्षण की आनुवंशिक भिन्नता का एक असमान रूप से बड़ा हिस्सा बताता है। ये निष्कर्ष सीधे लक्षित मार्कर-सहायता प्राप्त चयन को सूचित करते हैं, एक बार जब एक मान्य संबंधित मार्कर उपलब्ध हो जाता है, बजाय इसके कि प्रजनकों को केवल धीमे, व्यापक जीनोमिक चयन या अकेले फेनोटाइपिक चयन पर निर्भर रहना पड़े। अध्ययन की शक्ति, यानी एक सच्ची आनुवंशिक संगति का मज़बूती से पता लगाने की क्षमता, न कि एक झूठी सांख्यिकीय कलाकृति की, नमूना आकार और लक्षण की अंतर्निहित आनुवंशिक वास्तुकला पर बहुत अधिक निर्भर करती है, क्योंकि कई जीनों द्वारा नियंत्रित एक लक्षण, जिनमें से प्रत्येक का छोटा व्यक्तिगत प्रभाव होता है, को मज़बूती से पता लगाने के लिए एक बहुत बड़ी अध्ययन आबादी की आवश्यकता होती है, जबकि एक या कुछ जीनों द्वारा नियंत्रित लक्षण, जिनका बड़ा व्यक्तिगत प्रभाव होता है, के लिए ऐसा नहीं होता। इसका मतलब है कि जटिल, बहुजीनी लक्षणों के लिए GWAS के निष्कर्ष आमतौर पर प्रत्यक्ष मार्कर-सहायता प्राप्त चयन के लिए सरल, बड़े-प्रभाव वाले लक्षणों के निष्कर्षों की तुलना में कम तत्काल कार्रवाई योग्य होते हैं। प्रजनन निर्णयों के लिए GWAS के निष्कर्ष पर भरोसा करने से पहले एक स्वतंत्र आबादी में उसे मान्य करना मानक अभ्यास है, क्योंकि एक विशिष्ट आबादी और वातावरण में पता चला साहचर्य बिना पुष्टि के स्वचालित रूप से किसी भिन्न आबादी या वातावरण में सामान्यीकृत नहीं होता है। यह सावधानी विशेष रूप से रोग-प्रतिरोधक क्षमता के निष्कर्षों के लिए प्रासंगिक है, जहाँ मूल अध्ययन में उपयोग किए गए विशिष्ट रोगजनक स्ट्रेन और चुनौती की स्थितियाँ किसी भिन्न प्रजनन कार्यक्रम की आबादी की स्थितियों से मेल नहीं खा सकती हैं।