एक्वापोनिक्स के लिए ठोस अपशिष्ट का खनिजीकरण
ठोस अपशिष्ट खनिजीकरण मछली के अपशिष्ट, न खाए गए चारे और ठोस मल के कणिकीय अंश को, एक समर्पित पाचन कक्ष या अवसादन टैंक में जीवाणु अपघटन के माध्यम से, घुले हुए, पौधों के लिए उपलब्ध पोषक तत्वों के रूपों में परिवर्तित करता है। यह विशेष रूप से एक्वापोनिक्स प्रणाली डिजाइनों, जैसे एनएफटी (NFT) और डीडब्ल्यूसी (DWC) और अधिकांश डिकपल्ड (decoupled) प्रणालियों के लिए एक आवश्यक मध्यवर्ती कदम है, जहाँ कच्चे ठोस कणों को सीधे पौधे उगाने वाले क्षेत्र में जाने की अनुमति नहीं दी जा सकती है, क्योंकि इससे रुकावट, जड़ों के आसपास ऑक्सीजन की कमी या रोगजनक जोखिम हो सकता है। खनिजीकरण प्रक्रिया को पर्याप्त समय और आमतौर पर कुछ हद तक वातन (aeration) की आवश्यकता होती है ताकि अपघटन करने वाले वायवीय (aerobic) और वैकल्पिक (facultative) जीवाणुओं का समर्थन किया जा सके। छोटे आकार की या खराब वातित खनिजीकरण इकाइयाँ स्वयं अवायवीय (anaerobic) हो सकती हैं, जिससे हाइड्रोजन सल्फाइड और अन्य यौगिक उत्पन्न होते हैं जो पौधे के पक्ष को लाभ पहुँचाने के बजाय नुकसान पहुँचाएंगे यदि उस पानी को फिर विकास प्रणाली में पेश किया जाता है। इसका अर्थ है कि खनिजीकरण इकाई डिजाइन में वही अवायवीय-बचने के सिद्धांत लागू होते हैं जो व्यापक जलीय कृषि ठोस और कीचड़ प्रबंधन में लागू होते हैं। परिणामी खनिजीकृत तरल आउटपुट मछली टैंक से अकेले स्पष्ट पानी की तुलना में घुले हुए पोषक तत्वों, विशेष रूप से फास्फोरस और ठोस अपशिष्ट में बंधे विभिन्न सूक्ष्म पोषक तत्वों में काफी समृद्ध होता है जो अन्यथा ठोस रूप में पौधों के लिए काफी हद तक अनुपलब्ध रहते। यह खनिजीकृत ठोस अपशिष्ट को एक सार्थक पूरक पोषक तत्व स्रोत बनाता है जो मछली टैंक के मुख्य जल प्रवाह से अकेले घुले हुए अपशिष्ट से मिलने वाले पोषक तत्वों से परे समग्र प्रणाली पोषक तत्व संतुलन में सुधार करता है। मीडिया बेड एक्वापोनिक्स प्रणालियाँ बढ़ते बेड के अपने सब्सट्रेट के भीतर निष्क्रिय रूप से एक तुलनीय खनिजीकरण कार्य प्राप्त करती हैं, जहाँ ठोस पदार्थ सीधे पौधों की जड़ों के बीच जमा होते हैं और विघटित होते हैं, जो इस बात का एक हिस्सा है कि मीडिया बेड प्रणालियाँ एनएफटी (NFT), डीडब्ल्यूसी (DWC), या डिकपल्ड (decoupled) डिजाइनों की तुलना में कम समर्पित अलग खनिजीकरण बुनियादी ढांचे के साथ सफलतापूर्वक क्यों काम कर सकती हैं।