Depresi Inbreeding

Depresi inbreeding adalah penurunan kebugaran, pertumbuhan, kelangsungan hidup, dan kinerja reproduksi yang terjadi ketika ikan yang berkerabat dikawinkan dan keturunan menjadi homozigot untuk alel resesif yang merugikan. Dalam akuakultur, ini terakumulasi secara diam-diam karena segelintir pasangan induk dapat menghasilkan ribuan keturunan yang menyemai seluruh peternakan, dan dalam populasi penetasan tertutup, tingkat inbreeding meningkat kira-kira 1/(2Ne) per generasi, di mana Ne adalah ukuran populasi efektif. Efek yang terukur meliputi penurunan 1 hingga 2% per 10% koefisien inbreeding (F) pada berat badan, peningkatan tingkat malformasi larva, penurunan kualitas sperma, dan ketahanan terhadap penyakit yang jauh lebih rendah; studi salmonid menunjukkan penalti kelangsungan hidup sebesar 5 hingga 15% pada nilai F di atas 0,10. Pertahanan praktis bersifat disengaja: pertahankan setidaknya 50 hingga 100 induk yang tidak berkerabat per generasi, rotasi pasangan kawin dengan verifikasi silsilah atau DNA keturunan, kriopreservasi milt dari jantan pendiri, dan pantau inbreeding yang terealisasi dengan penanda genomik daripada mengasumsikan silsilah benar. Depresi inbreeding adalah alasan utama mengapa galur penetasan kecil dan terisolasi menurun setelah beberapa generasi, dan ini merusak keuntungan dari program pemuliaan selektif apa pun. Ini adalah penyeimbang langsung terhadap intensitas seleksi keluarga dan harus dikelola bersama dengan ukuran populasi efektif dan eksploitasi heterosis dalam program hibrida.