Analyse van Populatiegenetische Structuur (Broedstock Inkoop)

Analyse van de genetische populatiestructuur gebruikt gegevens van genetische markers om te karakteriseren hoe genetisch verschillend of gelijk verschillende kandidaatbronpopulaties voor kwekers, verschillende wilde populaties, verschillende bestaande foklijnen op boerderijen, daadwerkelijk van elkaar zijn, informatie die direct relevant is voor een fokprogramma dat beslist of en hoe nieuw genetisch materiaal van een aanvullende bronpopulatie in de bestaande fokkern moet worden opgenomen. Genetisch verschillende bronpopulaties kunnen waardevolle nieuwe genetische diversiteit bieden, mogelijk inclusief allelen voor ziektebestendigheid of andere gunstige eigenschappen die niet aanwezig zijn in de huidige fokpopulatie, maar het introduceren van genetisch zeer verschillend materiaal brengt ook het risico met zich mee dat gevestigde genetische vooruitgangen verstoord worden als de algehele prestaties van het nieuwe materiaal slechter zijn op kenmerken waarop het programma al generaties lang heeft ingezet, wat betekent dat structuuranalyse een fokprogramma helpt om een geïnformeerde, op bewijs gebaseerde beslissing te nemen over het kruisen met nieuw genetisch materiaal in plaats van nieuwe ouderdieren puur op veronderstelling of gemak te introduceren zonder het werkelijke genetische verband dat wordt ingebracht te begrijpen. Het detecteren van onbedoelde populatiestructuur binnen wat werd aangenomen een enkele, genetisch samenhangende fokpopulatie te zijn, en het ontdekken dat het bestaande ouderdierenbestand van een programma onbedoeld is verdeeld in genetisch onderscheiden subgroepen, mogelijk als gevolg van historisch afzonderlijke herkomst of onvoldoende mengen over fokfaciliteit locaties, is op zichzelf een waardevolle diagnostische bevinding die anders raadselachtige inconsistenties in waargenomen eigenschappen of schattingen van fokwaarden over wat werd aangenomen een uniforme populatie te zijn kan verklaren. Specifiek voor de verzameling van wilde ouderdieren helpt een analyse van de populatiestructuur van de doelpopulatie kweeksprogramma's te begrijpen hoe representatief hun daadwerkelijk uit het wild gevangen stichtingsmonster is voor de genetische diversiteit van de bredere wilde populatie, en informeert het over beslissingen of aanvullende wildvangsten over een breder geografisch of genetisch bereik nodig zijn om een voldoende diverse stichtende kweekpopulatie op te richten, in plaats van per ongeluk een nieuwe kweeklijn te stichten op een smal, niet-representatief genetisch monster.