Инструменты управления геномным инбридингом
Геномное управление инбридингом напрямую измеряет фактически общий генетический материал между потенциальными племенными парами на основе их генотипов маркеров, а не оценивает родство косвенно только по записям родословной. Это позволяет получить более точную и иногда существенно отличающуюся картину истинного генетического родства, чем дают оценки, основанные на родословной, поскольку записи родословной предполагают теоретически ожидаемое родство на основе зарегистрированного происхождения, в то время как фактическое геномное родство может варьироваться от особи к особи из-за случайного характера того, какой конкретный генетический материал каждое потомство фактически наследует от каждого родителя. Эта геномная точность имеет практическое значение, потому что две особи с идентичным коэффициентом родства, предсказанным по родословной, например, обе рассчитанные как полусибсы, могут иметь существенно различное фактическое геномное родство в зависимости от того, какие конкретные сегменты хромосом они унаследовали. Это означает, что решение о спаривании, основанное на геномных данных, иногда может выявить действительно менее родственную пару для спаривания среди особей, которые по записям родословной были бы оценены как одинаково родственные, что напрямую улучшает способность программы разведения управлять инбридингом более точно, чем позволяют только методы, основанные на родословной. Отбор оптимального вклада (Optimal Contribution Selection) — подход к оптимизации пар для спаривания, все чаще используемый наряду с данными о геномном родстве, математически балансирует максимизацию общего генетического прогресса в племенной популяции с ограничением темпов увеличения инбридинга до устойчивого долгосрочного уровня. Он рассматривает управление инбридингом как явное, количественно выраженное ограничение в оптимизации программы разведения, а не как неформальную, постфактумную проверку решений о спаривании, уже принятых в основном на основе только критериев продуктивности. Программы разведения без родословных или с неполными родословными, где исторические записи о происхождении отсутствуют или ненадежны (что особенно часто встречается в диких или недавно созданных племенных стадах), могут использовать данные о геномном родстве в качестве основной основы для управления инбридингом, полностью независимо от записей родословной. Эта возможность сделала геномные инструменты особенно ценными для новых программ разведения, работающих с менее документированными популяциями-основателями.
