การผลิตกล้าพันธุ์สาหร่าย (สปอร์/แกมีโทไฟต์)
การผลิตกล้าพันธุ์สาหร่ายมีความแตกต่างกันอย่างสิ้นเชิงระหว่างชนิดที่ขยายพันธุ์โดยไม่ใช้เพศกับชนิดที่ต้องใช้กล้าพันธุ์จากการเพาะฟักที่มีการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศอย่างแท้จริง: สาหร่ายสีแดงจำพวก Kappaphycus และสาหร่ายสกัดคาราจีแนนอื่นๆ มักขยายพันธุ์อย่างง่ายๆ โดยการตัดทัลลัสที่สมบูรณ์ให้เป็นท่อนๆ แล้วนำไปผูกติดกับเชือกเลี้ยง ซึ่งจะเจริญเติบโตต่อได้โดยตรงโดยไม่ต้องผ่านระยะสปอร์หรือแกมีโทไฟต์เลย ในขณะที่สาหร่ายเคล์ปและสาหร่ายสีน้ำตาลอื่นๆ หลายชนิดต้องอาศัยกระบวนการโรงเพาะฟักที่แท้จริง โดยการปล่อยสปอร์จากใบสปอโรไฟต์ที่โตเต็มวัย เพาะเลี้ยงระยะแกมีโทไฟต์ที่มีขนาดเล็กมากๆ ภายใต้สภาวะควบคุมในร่ม และในที่สุดจึงทำการเพาะเชื้อแกมีโทไฟต์นั้นลงบนเชือกที่พันรอบหลอด ก่อนจะนำไปปล่อยลงในแหล่งน้ำเปิดเพื่อเติบโตเป็นผลผลิตสปอโรไฟต์ที่มองเห็นและเก็บเกี่ยวได้ กระบวนการเพาะฟักที่อาศัยระยะแกมีโทไฟต์สำหรับสาหร่ายเคล์ปและสาหร่ายที่คล้ายคลึงกัน จำเป็นต้องมีการควบคุมแสง อุณหภูมิ และสารอาหารอย่างแม่นยำเพื่อกระตุ้นการปล่อยสปอร์และการพัฒนาพร้อมกับการปฏิสนธิของแกมีโทไฟต์ ซึ่งเป็นกระบวนการที่มีความต้องการทางเทคนิคและต้องควบคุมสูงกว่าการขยายพันธุ์ด้วยการตัดชิ้นส่วนแบบง่ายๆ และการพึ่งพาโรงเพาะฟักนี่เองที่เป็นข้อจำกัดในการขยายสเกลการเพาะเลี้ยงสาหร่ายเคล์ปในบางภูมิภาคเมื่อเทียบกับการขยายพันธุ์ด้วยชิ้นส่วนที่ใช้โครงสร้างพื้นฐานน้อยกว่าในสาหร่ายคาราจีแนนเขตร้อน คุณภาพของเชือกพันธุ์ ความหนาแน่นและความสมบูรณ์ของการเจริญเติบโตของแกมีโทไฟต์บนเชือกพันธุ์ก่อนนำไปติดตั้งในภาคสนาม จะเป็นตัวทำนายผลผลิตในแปลงเลี้ยงได้โดยตรง ทำให้การผลิตเมล็ดพันธุ์จากโรงเพาะฟักเป็นจุดควบคุมคุณภาพที่เฉพาะเจาะจง ซึ่งเทียบได้กับการประเมินคุณภาพตัวอ่อนในโรงเพาะฟักปลาและกุ้ง แม้ว่าชีววิทยาเบื้องหลังจะแตกต่างกันอย่างสิ้นเชิง ความหลากหลายทางพันธุกรรมและการคัดเลือกสายพันธุ์ภายในสต็อกพันธุ์ที่ผลิตจากโรงเพาะฟักเป็นThe area of seaweed breeding research that is becoming increasingly active, paralleling, though less mature than, the selective breeding programs established for finfish, shrimp, and bivalves.