Hastalık Direnci Genetik Haritalaması (Türlere Özgü)
Hastalık direnci genetik haritalama araştırmaları, ekonomik açıdan önemli birçok su ürünleri hastalığı için, bir bireyin patojene maruz kaldığında hayatta kalma olasılığı veya hastalık şiddeti üzerinde büyük, iyi karakterize edilmiş etkilere sahip belirli genomik bölgeleri tanımlamıştır. Belgelenmiş örnekler arasında somon balıklarındaki viral hastalıklar, çeşitli yetiştiriciliği yapılan yüzgeçli balıklardaki belirli bakteriyel ve paraziter hastalıklar ile yetiştiriciliği yapılan karideslerdeki viral hastalıklar bulunmaktadır. Bu büyük etkili bulgular ticari açıdan özellikle değerlidir çünkü poligenik bir özellik için tam genomik seçilimin gerektireceği daha büyük referans popülasyonlar ve daha karmaşık istatistiksel modelleme yerine doğrudan, verimli belirteç destekli seçilimi mümkün kılarlar. Hastalık direncinin altında yatan genetik mimari, belirli hastalık ve konakçı türüne göre önemli ölçüde değişir; bazı hastalıklar, direnç varyasyonunun önemli bir kısmını açıklayan tek bir dominant büyük etkili genomik bölge gösterirken, bu durum hedeflenen belirteç destekli seçilimi oldukça etkili ve uygulaması nispeten basit hale getirir. Diğer hastalıklar ise genom boyunca dağılmış birçok küçük etkili genomik bölge tarafından kontrol edilen direnci gösterir, bu da bu daha karmaşık, poligenik genetik mimariyi yeterince yakalamak için daha kapsamlı genomik seçilim yaklaşımını ve daha büyük eğitim popülasyonlarını gerektirir. Bir belirli patojen suşuna karşı haritalanmış ve doğrulanmış direnç, farklı bir suşa veya ilgili ancak genetik olarak farklı bir patojene karşı otomatik olarak direnç sağlamaz; bu belgelenmiş sınırlama, tek bir doğrulanmış direnç belirtecinin zamanla evrimleşmeye devam edebilecek bir patojen türünün tüm çeşitliliğine karşı kalıcı, geniş koruma sağladığını varsaymak yerine, birden fazla dolaşımdaki patojen suşu ve varyantı arasındaki direnç mekanizmalarını karakterize etmeye yönelik devam eden araştırma ilgisini tetiklemiştir. Genetik belirteçler kullanarak hastalık direnci için seçilim yaparken, diğer önemli üretim özellikleri üzerindeki olası ilişkili olumsuz etkileri izlemekle dengelemek gerekir, çünkü bazı türlerde ve hastalık kombinasyonlarında hastalık direnci ile büyüme oranı veya diğer performans özellikleri arasında belgelenmiş bir ödünleşim gözlemlenmiştir. Bu durum, ıslah programlarının genellikle hastalık direnci seçilimini, diğer ticari açıdan önemli özelliklerle potansiyel etkileşimini göz ardı ederek yalnızca direnci optimize etmek yerine, daha geniş çok özellikli bir ıslah hedefi içinde değerlendirdiği anlamına gelir.
İlgili terimler
- Su Ürünleri Yetiştiriciliğinde Genom Çapında İlişkilendirme Çalışmaları (GWAS)
- Kantitatif Özellik Lokusları (QTL) Haritalaması
- Tüm Genom Dizileme Uygulamaları (Damızlık)
- Genomik Seçilim Eğitim Popülasyonu Tasarımı
- Markör Destekli Seçilim
- Aşı Etkinliği Zorlama Testi
- Konak-Parazit Ko-Evrimi ve Direnç
- Tilapia Göl Virüsü (TiLV)