Diagnostic de co-infection et de complexe de maladies
Le diagnostic de co-infection et de complexe de maladies reconnaît qu'une part significative des événements de mortalité en aquaculture, documentés à travers les exemples de microsporidiose-Vibrio chez la crevette et de syndrome des fèces blanches discutés ailleurs dans ce groupe, ainsi que de nombreuses autres épidémies étudiées chez les poissons et les crustacés, impliquent plus d'un agent pathogène ou facteur de stress contributif agissant ensemble plutôt qu'un seul agent causal clairement isolé. Cette reconnaissance a poussé la pratique diagnostique dans l'industrie vers des panels de dépistage plus larges et multi-pathogènes, plutôt que des flux de travail diagnostiques qui arrêtent les tests une fois qu'un seul agent pathogène plausible a été confirmé. Une approche diagnostique complète exige de tester un échantillon soumis contre un panel d'agents pathogènes connus ou suspectés d'être pertinents pour la présentation clinique spécifique et le contexte de production, plutôt que de tester séquentiellement uniquement l'agent pathogène le plus cliniquement évident ou historiquement le plus courant en premier. En effet, un flux de travail qui arrête l'investigation après avoir confirmé un seul agent pathogène risque de passer à côté d'un deuxième facteur réellement contributif, sous-estimant systématiquement la complexité de la maladie et pouvant conduire à une réponse de gestion incomplète ou finalement inefficace qui ne s'attaque qu'à une partie du problème sous-jacent réel. Les méthodes statistiques et épidémiologiques pour établir une contribution causale réelle dans un complexe de maladies multi-pathogènes, distinguant un agent pathogène qui contribue réellement à la gravité de la maladie observée d'un autre qui est présent par hasard mais ne contribue pas significativement au résultat clinique, nécessitent des approches analytiques plus sophistiquées que de simplement noter que plusieurs agents pathogènes ont été détectés dans les échantillons affectés, car la corrélation et la co-occurrence seules n'établissent pas qu'un agent pathogène secondaire détecté contribue réellement de manière causale à la gravité de la maladie plutôt que d'être une découverte incidente et non contributive. Ce cadre diagnostique multifactoriel a des implications directes en matière de gestion, car un complexe de maladies nécessite généralement une stratégie d'intervention abordant simultanément plusieurs facteurs contributifs (qualité de l'eau, un agent pathogène primaire, un agent pathogène secondaire prédisposant, gestion du stress), plutôt que l'intervention plus simple et à cible unique qui serait appropriée si un seul agent pathogène clairement isolé était confirmé comme étant le seul agent causal. Cela renforce la raison pour laquelle un diagnostic précis et complet de co-infection détermine directement si la réponse de gestion ultérieure d'une ferme s'attaque réellement au problème sous-jacent réel et complet.
