疾病抵抗性の遺伝子マッピング(種特異的)
疾病抵抗性の遺伝子マッピング研究により、いくつかの経済的に重要な水産養殖疾病において、病原体に曝露された際の個体の生存確率や疾病の重症度に大きな、よく特徴づけられた影響を与える特定のゲノム領域が特定されています。その例としては、サケのウイルス性疾病、様々な養殖魚の特定の細菌性・寄生虫性疾病、養殖エビのウイルス性疾病などが記録されており、これらの主要な効果を持つ発見は、商業的に特に価値があることが証明されています。なぜなら、それらは、ポリジェニック形質に対する完全なゲノム選抜が要求するような、より大きな参照集団やより複雑な統計モデリングを必要とせず、直接的かつ効率的なマーカーアシスト選抜を可能にするからです。疾病抵抗性の根底にある遺伝的構造は、特定の疾病と宿主種によって大きく異なります。一部の疾病では、抵抗性変動の大部分を説明する単一の優性な大効果ゲノム領域が示され、標的型マーカーアシスト選抜が非常に効果的で比較的簡単に実施できます。一方、他の疾病では、ゲノム全体に分布する多くの小効果ゲノム領域によって抵抗性が制御されており、このより複雑なポリジェニックな遺伝的構造を適切に捉えるためには、より包括的なゲノム選抜アプローチとより大きな訓練集団が必要となります。ある特定の病原体株に対してマッピングされ検証された抵抗性が、異なる株や関連するが遺伝的に異なる病原体に対する抵抗性を自動的に付与するわけではありません。これは記録された限界であり、単一の検証済み抵抗性マーカーが、時間とともに進化し続ける可能性のある病原体種の多様性全体に対して持続的で広範な保護を提供すると仮定するのではなく、複数の循環する病原体株や変異体における抵抗性メカニズムを特性評価することへの継続的な研究関心を促しています。遺伝子マーカーを用いて疾病抵抗性を選抜する際には、他の重要な生産形質に対する相関する負の影響を監視することとのバランスを取る必要があります。なぜなら、一部の種と疾病の組み合わせにおいて、疾病抵抗性と成長速度または他のパフォーマンス形質との間にトレードオフが観察されているからです。これは、育種プログラムが、他の商業的に重要な形質との潜在的な相互作用を考慮せずに抵抗性のみを最適化するのではなく、より広範な多形質育種目標の中で疾病抵抗性選抜を評価することを意味します。