การปล้ําทางพันธุกรรมของโรค (พิเศษ)
งานวิจัยการทำแผนที่พันธุกรรมความต้านทานโรคได้ระบุว่า สำหรับโรคในอุตสาหกรรมเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจหลายประเภท มีบริเวณจีโนมเฉพาะที่มีผลอย่างมากและถูกลักษณะอย่างชัดเจนต่อโอกาสรอดชีวิตหรือความรุนแรงของโรคเมื่อสัมผัสกับเชื้อโรค ตัวอย่างที่มีเอกสารบันทึกครอบคลุมโรคไวรัสในปลาแซลมอน โรคแบคทีเรียเฉพาะและโรคปรสิตในปลาที่เพาะเลี้ยงหลายชนิด และโรคไวรัสในกุ้งเพาะเลี้ยง ผลการค้นพบที่มีผลใหญ่เหล่านี้มีคุณค่าเชิงพาณิชย์เป็นพิเศษ เนื่องจากช่วยให้สามารถคัดเลือกด้วยเครื่องหมายทางพันธุกรรมโดยตรงและมีประสิทธิภาพ แทนที่จะต้องใช้ประชากรอ้างอิงขนาดใหญ่และแบบจำลองทางสถิติเชิงซ้อนทั้งหมดในการคัดเลือกจีโนมอย่างเต็มรูปแบบ ลักษณะทางพันธุกรรมหลายยีนจะต้องการในอีกกรณีหนึ่ง สถาปัตยกรรมทางพันธุกรรมที่อยู่เบื้องหลังความต้านทานต่อโรคนั้นแตกต่างกันอย่างมากตามโรคเฉพาะและชนิดเจ้าบ้านบางโรคแสดงถึงภูมิภาคทางพันธุกรรมที่มีผลขนาดใหญ่โดดเด่นเพียงตัวเดียวซึ่งอธิบายส่วนแบ่งที่สำคัญของความแปรปรวนของความต้านทาน ทำให้การคัดเลือกโดยใช้เครื่องหมายพิเศษมีประสิทธิภาพสูงและค่อนข้างง่ายต่อการดำเนินการ ในขณะที่โรคอื่น ๆ แสดงให้เห็นว่าความต้านทานถูกควบคุมโดยภูมิภาคทางพันธุกรรมขนาดเล็กหลายแห่งกระจายไปทั่วจีโนม ซึ่งต้องการวิธีการคัดเลือกแบบจีโนมเต็มรูปแบบและประชากรฝึกอบรมขนาดใหญ่เพื่อจับสถาปัตยกรรมทางพันธุกรรมที่ซับซ้อนและหลายยีนนี้อย่างเพียงพอ ความต้านทานที่ถูกทำแผนที่และตรวจสอบแล้วต่อสายพันธุ์เชื้อโรคเฉพาะหนึ่ง ไม่ได้หมายความว่าจะให้ความต้านทานต่อสายพันธุ์อื่นหรือเชื้อโรคที่เกี่ยวข้องแต่มีความแตกต่างทางพันธุกรรม ซึ่งเป็นข้อจำกัดที่ได้รับการบันทึกไว้และเป็นแรงผลักดันให้เกิดความสนใจในการวิจัยอย่างต่อเนื่องเพื่อระบุกลไกความต้านทานในหลายสายพันธุ์และตัวแปรของเชื้อโรคที่แพร่ระบาด แทนที่จะสมมติว่าตัวชี้วัดความต้านทานที่ได้รับการตรวจสอบครั้งเดียวสามารถให้การป้องกันที่ยั่งยืนและกว้างขวางต่อความหลากหลายทั้งหมดของสายพันธุ์เชื้อโรคที่อาจยังคงวิวัฒนาการต่อไปตามเวลา การเลือกเพื่อความต้านทานโรคโดยใช้เครื่องหมายทางพันธุกรรมต้องสมดุลกับการเฝ้าติดตามผลกระทบเชิงลบที่สัมพันธ์กับลักษณะการผลิตที่สำคัญอื่น ๆ เนื่องจากมีการสังเกตว่ามีการแลกเปลี่ยนระหว่างความต้านทานโรคกับอัตราการเจริญเติบโตหรือคุณสมบัติการแสดงออกอื่น ๆ ในบางชนิดและการรวมกันของโรค ซึ่งหมายความว่าโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์มักจะประเมินการเลือกความต้านทานโรคภายในวัตถุประสงค์การปรับปรุงพันธุ์หลายลักษณะที่กว้างกว่า แทนที่จะปรับให้เหมาะสมเฉพาะความต้านทานโดยไม่พิจารณาการมีปฏิสัมพันธ์กับลักษณะที่มีความสำคัญทางการค้าอื่น ๆ
