การ ออก แบบ ประชากร เพื่อ ฝึก อบรม การ เลือก แบบ จี โนม
ประชากรสำหรับการฝึกอบรม ซึ่งเรียกอีกอย่างว่าประชากรอ้างอิง ในโปรแกรมการคัดเลือกเชิงจีโนม ประกอบด้วยสิ่งมีชีวิตที่มีทั้งข้อมูลเครื่องหมายจีโนมและการบันทึกการวัดลักษณะสัณฐานสำหรับลักษณะเป้าหมาย และความสัมพันธ์ทางสถิติที่เรียนรู้จากประชากรฝึกอบรมนี้คือสิ่งที่โปรแกรมปรับปรุงพันธุ์นำไปใช้ในการทำนายค่าสมรรถภาพการผสมพันธุ์สำหรับสัตว์ผู้สมัครรุ่นใหม่ที่มีข้อมูลจีโนมแต่ยังไม่ได้วัดลักษณะนั้น ทำให้ขนาด ประกอบ และความเกี่ยวข้องของประชากรฝึกอบรมกับประชากรปรับปรุงพันธุ์ปัจจุบันเป็นตัวกำหนดโดยตรงว่าการคาดการณ์ทางจีโนมสำหรับผู้สมัครใหม่จะมีความแม่นยำเพียงใด ประชากรฝึกอบรมที่มีขนาดเล็กเกินไปหรือมีความสัมพันธ์ไกลเกินไปกับประชากรผู้สมัครปัจจุบันที่กำลังถูกประเมินจะสร้างการทำนายที่ไม่น่าเชื่อถือและมีความแม่นยำน้อยลงไม่ว่ากระบวนการทำนายจีโนมทางสถิติขั้นสูงที่นำไปใช้กับข้อมูลการฝึกอบรมดังกล่าวจะซับซ้อนเพียงใด ซึ่งหมายความว่าโครงการปรับปรุงพันธุ์จะต้องปรับปรุงและขยายประชากรฝึกอบรมอย่างต่อเนื่องด้วยข้อมูลลักษณะปรากฏและจีโนไทป์ของแต่ละรุ่นใหม่ เพื่อรักษาความแม่นยำในการทำนายในขณะที่ส่วนประกอบทางพันธุกรรมของประชากรปรับปรุงพันธุ์ค่อย ๆ เปลี่ยนไปตามรุ่นการคัดเลือกต่อเนื่อง สำหรับลักษณะความต้านทานโรคโดยเฉพาะ การสร้างประชากรฝึกที่เพียงพอมักต้องการการทดสอบความท้าทายโดยเฉพาะ ซึ่งหมายถึงการเปิดรับตัวอย่างที่เป็นตัวแทนของประชากรที่ใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ต่อเชื้อโรคที่สนใจภายใต้สภาวะควบคุม และบันทึกผลการรอดชีวิตหรือความรุนแรงของโรคในแต่ละบุคคล เนื่องจากลักษณะทางพฤติกรรมของความต้านทานโรคมักไม่ปรากฏจากสภาพการผลิตทั่วไปซึ่งการเปิดรับและความกดดันของโรคไม่สามารถควบคุมได้และไม่สอดคล้องกันในประชากรทั้งหมด การตัดสินใจเกี่ยวกับการออกแบบประชากรฝึกอบรม ขนาดของตัวอย่างที่จะวิเคราะห์ลักษณะใหม่หรือที่ปรับปรุงแล้ว ความถี่ในการปรับปรุงประชากรฝึกอบรมด้วยข้อมูลรุ่นใหม่ มีผลโดยตรงต่อค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานของโครงการปรับปรุงพันธุ์อย่างต่อเนื่อง เนื่องจากการวิเคราะห์ลักษณะโดยเฉพาะสำหรับลักษณะที่ต้องการการทดสอบเฉพาะหรือการเก็บตัวอย่างแบบทำลาย มักมีค่าใช้จ่ายต่อรายบุคคลสูงกว่าการวิเคราะห์จีโนมมิกมาร์กเกอร์เพียงอย่างเดียว ทำให้ขนาดประชากรฝึกอบรมและความถี่ในการปรับปรุงเป็นการตัดสินใจแลกเปลี่ยนระหว่างค่าใช้จ่ายกับความแม่นยำอย่างแท้จริงที่ต้องคำนึงอย่างรอบคอบ แทนที่จะเป็นทางเลือกที่ตรงไปตรงมาที่เพียงต้องการเพิ่มขนาดประชากรฝึกอบรมให้มากที่สุดโดยไม่พิจารณาต้นทุน
