Disenyo ng Training Population para sa Genomic Selection
Ang populasyon ng pagsasanay, na tinatawag ding populasyon ng sanggunian, sa isang programang pagpili gamit ang genomics ay binubuo ng mga indibidwal na may parehong datos ng genomic marker at naitalang sukat ng phenotype para sa target na katangian, at ang estadistikal na ugnayan na natutunan mula sa populasyon ng pagsasanay na ito ang ginagamit ng programa ng pagpapalahi upang mahulaan ang mga halaga ng pagpapalahi para sa mga bagong, mas batang kandidato na hayop na may datos ng genomics ngunit hindi pa naipapakita ang phenotype para sa katangiang iyon, kaya ang laki, komposisyon, at kahalagahan ng populasyon ng pagsasanay sa kasalukuyang populasyon ng pagpapalahi ay direktang tumutukoy kung gaano katiyak ang mga magiging prediksyon ng genomics para sa mga bagong kandidato. Ang isang maliit o masyadong malayong kaugnay na populasyon para sa pagsasanay kumpara sa kasalukuyang populasyon na kandidato na sinusuri ay nagbubunga ng hindi maasahan at mababang-tumpak na mga hula anuman kung gaano pa kahusay ang ginagamit na estadistikal na metodong prediksyon ng genome sa datos ng pagsasanay, na nangangahulugang ang mga programa sa pagpapalahi ay kailangang patuloy na i-update at palawakin ang kanilang populasyon para sa pagsasanay sa bawat bagong henerasyon gamit ang phenotype at genotype na datos, partikular upang mapanatili ang katumpakan ng prediksyon habang ang komposisyong genetiko ng populasyon ng pagpapalahi ay unti-unting nagbabago sa sunud-sunod na henerasyon ng seleksyon. Para sa mga katangian ng paglaban sa sakit partikular, ang pagbuo ng angkop na populasyon para sa pagsasanay ay karaniwang nangangailangan ng isang nakalaang pagsusuri sa hamon, na sadyang inilalantad ang isang kinatawan na sample ng populasyon ng pagpaparami sa pathogen ng interes sa ilalim ng kontroladong kondisyon at itinatala ang kaligtasan o kalubhaan ng sakit ng bawat indibidwal, dahil bihirang makuha ang mga phenotipo ng paglaban sa sakit mula sa karaniwang mga kondisyon ng produksyon kung saan ang pagkakalantad at presyon ng sakit ay hindi kontrolado at hindi pare-pareho sa buong populasyon. Ang mga desisyon sa disenyo ng populasyon para sa pagsasanay, gaano kalaking sample ang ipa-phenotype para sa isang bagong o na-update na katangian, gaano kadalas i-refresh ang populasyon para sa pagsasanay gamit ang bagong data ng henerasyon, ay direktang nakakaapekto sa patuloy na gastos sa pagpapatakbo ng isang programa sa pagpapa-breed, dahil ang phenotyping, lalo na para sa mga katangiang nangangailangan ng dedikadong challenge test o nakasisirang sampling, ay karaniwang mas mahal bawat indibidwal kaysa sa genomic marker genotyping lamang, ginagawa ang laki ng populasyon para sa pagsasanay at dalas ng pag-refresh nito bilang isang tunay, maingat na pinag-isipang desisyon sa kalakip ng gastos-kontra-tiyak na resulta kaysa isang simpleng pagpili na palakihin lamang ang populasyon para sa pagsasanay nang walang konsiderasyon sa gastos.
