जीनोमिक चयन प्रशिक्षण जनसंख्या डिज़ाइन

एक जीनोमिक चयन कार्यक्रम में प्रशिक्षण जनसंख्या, जिसे संदर्भ जनसंख्या भी कहा जाता है, में ऐसे व्यक्ति शामिल होते हैं जिनके पास लक्ष्य लक्षण के लिए जीनोमिक मार्कर डेटा और रिकॉर्ड किए गए फेनोटाइप माप दोनों होते हैं। इस प्रशिक्षण जनसंख्या से सीखा गया सांख्यिकीय संबंध ही प्रजनन कार्यक्रम द्वारा नए, युवा उम्मीदवार जानवरों के लिए प्रजनन मूल्यों की भविष्यवाणी करने के लिए लागू किया जाता है, जिनके पास जीनोमिक डेटा तो होता है लेकिन उस लक्षण के लिए अभी तक फेनोटाइप नहीं किया गया होता है। इससे प्रशिक्षण जनसंख्या का आकार, संरचना और वर्तमान प्रजनन जनसंख्या से इसकी प्रासंगिकता सीधे यह निर्धारित करती है कि नए उम्मीदवारों के लिए परिणामी जीनोमिक भविष्यवाणियां वास्तव में कितनी सटीक होंगी। एक प्रशिक्षण जनसंख्या जो बहुत छोटी है या वर्तमान उम्मीदवार जनसंख्या से बहुत दूर से संबंधित है, अविश्वसनीय, कम-सटीकता वाली भविष्यवाणियां उत्पन्न करती है, भले ही उस प्रशिक्षण डेटा पर लागू अंतर्निहित सांख्यिकीय जीनोमिक भविष्यवाणी विधि कितनी भी परिष्कृत क्यों न हो। इसका मतलब है कि प्रजनन कार्यक्रमों को प्रत्येक नई पीढ़ी के फेनोटाइप और जीनोटाइप डेटा के साथ अपनी प्रशिक्षण जनसंख्या को लगातार अद्यतन और विस्तारित करना चाहिए, विशेष रूप से भविष्यवाणी सटीकता बनाए रखने के लिए क्योंकि प्रजनन जनसंख्या की आनुवंशिक संरचना चयन की क्रमिक पीढ़ियों में धीरे-धीरे बदलती रहती है। विशेष रूप से रोग-प्रतिरोधक लक्षणों के लिए, एक पर्याप्त प्रशिक्षण जनसंख्या बनाने के लिए आमतौर पर एक समर्पित चुनौती परीक्षण की आवश्यकता होती है, जिसमें प्रजनन जनसंख्या के एक प्रतिनिधि नमूने को नियंत्रित परिस्थितियों में रुचि के रोगज़नक़ के संपर्क में जानबूझकर लाया जाता है और प्रत्येक व्यक्ति के जीवित रहने या रोग की गंभीरता के परिणाम को रिकॉर्ड किया जाता है, क्योंकि रोग प्रतिरोधक फेनोटाइप सामान्य उत्पादन स्थितियों से शायद ही कभी उपलब्ध होते हैं जहां जोखिम और रोग का दबाव अनियंत्रित और पूरी आबादी में असंगत होता है। प्रशिक्षण जनसंख्या डिज़ाइन के निर्णय, जैसे कि एक नए या अद्यतन लक्षण के लिए कितने बड़े नमूने का फेनोटाइप करना है, प्रशिक्षण जनसंख्या को नए पीढ़ीगत डेटा के साथ कितनी बार ताज़ा करना है, सीधे एक प्रजनन कार्यक्रम की चल रही परिचालन लागत को प्रभावित करते हैं, क्योंकि फेनोटाइपिंग, विशेष रूप से उन लक्षणों के लिए जिन्हें एक समर्पित चुनौती परीक्षण या विनाशकारी नमूने की आवश्यकता होती है, आमतौर पर जीनोमिक मार्कर जीनोटाइपिंग की तुलना में प्रति व्यक्ति कहीं अधिक महंगा होता है। इससे प्रशिक्षण जनसंख्या का आकार और ताज़ा करने की आवृत्ति एक वास्तविक, सावधानीपूर्वक विचार किया गया लागत-बनाम-सटीकता व्यापार-बंद निर्णय बन जाता है, बजाय इसके कि लागत पर विचार किए बिना प्रशिक्षण जनसंख्या के आकार को अधिकतम करने का एक सीधा विकल्प हो।