有効集団サイズ（Ne）

有効集団サイズ（Ne）とは、集団内で実際に次世代に遺伝子を寄与する繁殖個体の数を指します。これは、家族サイズの不均一性、性比の偏り、繁殖成功率のばらつきのため、常に親魚の総数よりも少なくなります。孵化場の実務では、200匹の親魚を収容する水槽でも、数匹の優勢な雄と非常に多産な雌が不均衡な数の子孫を残すため、Neはわずか20～50になることがあります。運用上の規則はNeから導き出されます。近交係数は世代あたり約1/(2Ne)の割合で上昇し、遺伝的多様性も同じ割合で失われるため、年間近交係数を0.5～1%未満に抑えるにはNeが少なくとも50必要であり、長期的な保全基準ではNeが500以上であることが求められます。推奨される実践方法には、家系ごとの寄与を均等にすること、雌雄比を1:1から2:1に維持すること、貴重な雄の寄与を延長するために精液を凍結保存すること、そして想定された交配が実際に起こったことをDNA親子鑑定で確認することなどが含まれます。Neは、あらゆる選抜育種プログラムにおける中心的な計画数値です。これにより、どの程度厳しく選抜できるか、維持できる家系の数、そして近交弱勢が問題となるまでの速さが決まります。これは家系選抜の設計、ゲノム選抜の強度、および親魚管理方針に直接関連します。