גודל אוכלוסייה אפקטיבי (Ne)

גודל אוכלוסייה אפקטיבי (Ne) הוא מספר הפרטים המתרבים באוכלוסייה שתורמים בפועל גנים לדור הבא, תמיד קטן יותר מספירת המלאי של דגי הרבייה בשל גודל משפחות לא שווה, יחסי מינים מוטים, ושונות בהצלחת הרבייה. בפועל במדגרה, מיכל המכיל 200 דגי רבייה עשוי להיות בעל Ne של 20 עד 50 בלבד, מכיוון שמספר זכרים דומיננטיים ונקבות פוריות במיוחד משאירים מספר לא פרופורציונלי של צאצאים. הכללים התפעוליים נובעים מ-Ne: רביית קרובים עולה בכ-1/(2Ne) לדור, והמגוון הגנטי אובד באותו קצב, כך ששמירה על רביית קרובים שנתית מתחת ל-0.5 עד 1% דורשת Ne של לפחות 50, ותקני שימור לטווח ארוך דורשים Ne מעל 500. פרקטיקות מומלצות כוללות השוואת תרומות משפחתיות, שמירה על יחס נקבות לזכרים של 1:1 עד 2:1, שימור זרע בהקפאה כדי להאריך את תרומתם של זכרים בעלי ערך, ושימוש בהורות DNA כדי לוודא שההזדווגויות המשוערות אכן התרחשו. Ne הוא המספר המרכזי לתכנון בכל תוכנית טיפוח סלקטיבי: הוא קובע עד כמה ניתן לבצע ברירה חזקה, כמה משפחות ניתן להרשות לעצמנו לשמור, ובאיזו מהירות שפל רביית קרובים הופך לבעיה. הוא מתחבר ישירות לתכנון ברירת משפחות, עוצמת ברירה גנומית, ומדיניות ניהול דגי רבייה.