ניתוח מבנה גנטי של אוכלוסייה (מקורות רבייה)
ניתוח מבנה גנטי של אוכלוסייה משתמש בנתוני סמנים גנטיים כדי לאפיין עד כמה שונות או דומות גנטית אוכלוסיות מקור פוטנציאליות של דגי רבייה, אוכלוסיות בר שונות, וקווי רבייה קיימים בחוות, זו מזו. מידע זה רלוונטי ישירות לתוכנית רבייה המחליטה האם וכיצד לשלב חומר גנטי חדש מאוכלוסיית מקור נוספת לגרעין הרבייה הקיים שלה. אוכלוסיות מקור שונות גנטית יכולות להציע מגוון גנטי חדש ובעל ערך, כולל פוטנציאלית אללים עמידים למחלות או תכונות מועילות אחרות שאינן קיימות באוכלוסיית הרבייה הנוכחית, אך הכנסת חומר שונה גנטית מאוד טומנת בחובה גם את הסיכון לשיבוש רווחים גנטיים מבוססים אם הביצועים הכוללים של החומר החדש נמוכים יותר בתכונות שהתוכנית כבר השקיעה דורות בשיפורן. כלומר, ניתוח מבנה מסייע לתוכנית רבייה לקבל החלטה מושכלת ומבוססת ראיות לגבי הכלאה עם חומר גנטי חדש, במקום להכניס דגי רבייה חדשים על בסיס הנחה או נוחות בלבד, ללא הבנה של הקשר הגנטי האמיתי המוכנס. איתור מבנה אוכלוסייה בלתי מכוון בתוך מה שנחשב לאוכלוסיית רבייה אחת, קוהרנטית גנטית, גילוי שדגי הרבייה הקיימים של תוכנית התפצלו בטעות לתת-קבוצות הניתנות להבחנה גנטית, אולי עקב מקורות נפרדים היסטורית או ערבוב לא מספק בין מיקומי מתקני רבייה, הוא ממצא אבחוני בעל ערך בפני עצמו שיכול להסביר אי-התאמות מבלבלות אחרות בביצועי תכונות נצפים או בהערכות ערך רבייה על פני מה שנחשב לאוכלוסייה אחידה. באופן ספציפי לאיסוף דגי רבייה מהבר, ניתוח מבנה האוכלוסייה של אוכלוסיית הבר הממוקדת מסייע לתוכניות רבייה להבין עד כמה מדגם המייסדים שנתפס בבר מייצג את המגוון הגנטי של אוכלוסיית הבר הרחבה יותר, ומספק מידע להחלטות האם נדרש מאמץ איסוף נוסף מהבר על פני טווח גאוגרפי או גנטי רחב יותר כדי להקים אוכלוסיית רבייה מייסדת מגוונת מספיק, במקום להקים בטעות קו רבייה חדש על מדגם גנטי צר ולא מייצג.
