家系選抜と血統記録

家系選抜は、魚の全同胞または半同胞の家系全体を別々の水槽で飼育するか、マイクロチップでタグ付けし、成長、生存率、フィレ歩留まり、疾病抵抗性などの性能形質が測定できるようになるまで育て、最良の家系を次世代の親として選ぶ育種戦略です。魚は何百もの子孫を産み、視覚的に個体を識別できないため、通常、受動集積型トランスポンダー（PIT）タグ、DNA親子鑑定、または物理的な家系飼育による血統記録が必須となります。家系平均は、水槽や飼料の影響を平均化するため、個体記録よりも正確ですが、家系数が少なすぎると近交係数のリスクも露呈します。実用的なプログラムでは、通常、世代ごとに50〜200の家系を評価し、上位20〜30を繁殖親として保持し、選抜された親間の血縁関係を最小限に抑える交配設計（要因計画またはネスト型）を使用します。その運用上の成果は大きく、成長に関する家系平均に基づく選抜は、集団内の一斉選抜よりもはるかに少ない遺伝的浮動で、世代あたり5〜15%の改善を日常的に実現します。家系選抜は、サケ、マス、タイ、ティラピアなどのほとんどの現代的な水産養殖育種プログラムの基盤であり、有効集団サイズ管理、マーカー支援選抜、ゲノム選抜と連携しています。