ゲノム選抜（水産養殖）

ゲノム選抜は、ゲノムワイドなマーカーデータ（通常は数万のSNP）と表現型記録を組み合わせて、候補親魚が繁殖年齢に達する前にその遺伝的価値（ゲノム推定育種価、GEBV）を予測する育種手法です。水産養殖では、疾病抵抗性やフィレ品質のような形質は、魚に負荷をかけたり屠殺したりすることによってのみ測定できるため、ゲノム選抜は革新的です。数千の遺伝子型が判明し表現型が記録された参照集団が予測モデルを訓練し、そのモデルが幼魚として遺伝子型が判明した数千の選抜候補に適用されます。ウミジラミ、細菌性疾患、ウイルス性膵臓病に対する抵抗性のGEBVの報告されている精度は、参照集団のサイズと形質の遺伝率に応じて0.4から0.8の範囲であり、従来の家系選抜と比較して選抜反応をほぼ2倍にします。運用上の結果として、世代交代の高速化、選抜決定あたりのコスト削減、そして以前は候補個体で測定するには費用がかかりすぎた形質を選抜する能力が得られます。ゲノム選抜には、SNPチップまたはシーケンシングへの継続的な投資、適切に維持された血統記録、および集中的なマーカーベースの選抜が遺伝的多様性を損なわないようにするための有効集団サイズの慎重な管理が必要です。現在、タイセイヨウサケの育種では標準となっており、エビ、マダイ、ティラピアのプログラムにも広がりつつあります。