Genomische Selektion (Aquakultur)

Genomische Selektion ist eine Zuchtmethode, die genomweite Markerdaten, typischerweise Zehntausende von SNPs, zusammen mit phänotypischen Aufzeichnungen verwendet, um den genetischen Wert (genomisch geschätzter Zuchtwert, GEBV) von Kandidaten für den Zuchtbestand vorherzusagen, bevor diese das Fortpflanzungsalter erreichen. In der Aquakultur, wo Merkmale wie Krankheitsresistenz und Filetqualität nur durch Belastung oder Schlachtung von Fischen gemessen werden können, ist die genomische Selektion transformativ: Eine Referenzpopulation von einigen Tausend genotypisierten und phänotypisierten Fischen trainiert ein Vorhersagemodell, das dann auf Tausende von als Jungfische genotypisierten Selektionskandidaten angewendet wird. Die berichteten Genauigkeiten von GEBVs für die Resistenz gegen Seeläuse, bakterielle Krankheiten und virale Pankreaserkrankungen reichen von 0,4 bis 0,8, abhängig von der Größe der Referenzpopulation und der Heritabilität des Merkmals, was die Selektionsantwort im Vergleich zur traditionellen Familienselektion ungefähr verdoppelt. Die operativen Konsequenzen sind schnellere Generationen, geringere Kosten pro Selektionsentscheidung und die Möglichkeit, Merkmale zu selektieren, deren Messung bei Kandidaten zuvor zu teuer war. Die genomische Selektion erfordert nachhaltige Investitionen in SNP-Chips oder Sequenzierung, einen gut gepflegten Stammbaum und eine sorgfältige Kontrolle der effektiven Populationsgröße, damit eine intensive Marker-basierte Selektion die genetische Vielfalt nicht zusammenbrechen lässt. Sie ist heute Standard in der Zucht von Atlantischem Lachs und verbreitet sich auf Programme für Garnelen, Meerbrassen und Tilapia.