การ ตรวจ วินิจฉัย โรค (พ.ศ.
เอนไซม์ลิงก์อิมมูโนซอร์บเอนท์แอสเซย์ (ELISA) ตรวจจับโปรตีนเฉพาะ ไม่ว่าจะเป็นแอนติเจนของเชื้อจุลชีพเองหรือแอนติบอดีที่สัตว์เจ้าบ้านสร้างขึ้นเพื่อตอบสนองต่อการติดเชื้อ โดยการจับเข้ากับแอนติบอดีที่ตรึงอยู่บนแผ่นและสร้างสัญญาณสีหรือฟลูออเรสเซนต์ที่สามารถวัดได้ซึ่งเป็นสัดส่วนกับปริมาณที่มี เทคนิคนี้โดยทั่วไปมีค่าใช้จ่ายถูกกว่าและทำได้รวดเร็วกว่าเมื่อทำในปริมาณมากเมื่อเทียบกับการทดสอบแบบ PCR แต่โดยปกติมีความไวต่ำกว่าในการตรวจจับปริมาณเชื้อที่ต่ำมาก และขึ้นอยู่กับการที่โปรตีนเป้าหมายต้องมีอยู่และสมบูรณ์ แทนที่จะตรวจจับสารพันธุกรรมของตัวเชื้อโดยตรง ELISA ตรวจหาสารแอนติเจนโดยตรงยืนยันการมีอยู่ของเชื้อในปัจจุบัน เหมาะสำหรับการคัดกรองอย่างรวดเร็วและต้นทุนต่ำในตัวอย่างจำนวนมาก เช่น การตรวจสุขภาพประจำฟาร์มหรือบ้านเลี้ยงลูกไก่ ในขณะที่ ELISA ตรวจหาภูมิต้านทานจะแสดงให้เห็นการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่ผ่านมา หรือกำลังดำเนินอยู่ เหมาะสำหรับการประเมินประวัติการสัมผัสเชื้อหรือประสิทธิผลของการฉีดวัคซีนในประชากร มากกว่าการยืนยันการติดเชื้อที่กำลังเกิดขึ้นในปัจจุบัน การใช้งานทั่วไปในอุตสาหกรรมการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำรวมถึงการตรวจจับสารพิษอย่างรวดเร็ว (เช่น การคัดกรองสารพิษหอยจำพวกพาราไลติกหรือไดแอเรียติกก่อนการเก็บเกี่ยว) และการตรวจคัดกรองโรคบางชนิดที่เกิดจากแบคทีเรียและปรสิต ซึ่งชุด ELISA ช่วยให้การทดสอบในพื้นที่หรือในฟาร์มสามารถทำได้โดยไม่จำเป็นต้องมีห้องปฏิบัติการโมเลกุลที่มีอุปกรณ์ครบครัน การเกิดปฏิกิริยาข้าม (cross-reactivity) คือการที่แอนติบอดีของการทดสอบจับกับโปรตีนที่คล้ายกันแต่ไม่ใช่เป้าหมาย ทำให้เกิดผลบวกเท็จ เป็นข้อจำกัดทางเทคนิคหลักที่จำเป็นต้องยืนยันกับตัวอย่างที่ทราบว่าเป็นลบก่อนที่ผล ELISA จะถูกพิจารณาเป็นการวินิจฉัยจริง ไม่ใช่เพียงเป็นข้อบ่งชี้เท่านั้น