דלקת מעיים בדגים מבויתים
דלקת מעיים היא דלקת של רירית המעי, הבולטת ביותר היא דלקת מעיים הנגרמת מקמח סויה (SBMIE) בסלמוניים ובדגי ים, המאופיינת באובדן הוואקואולות העל-גרעיניות התקינות בתאי ספיגה, חדירת תאים דלקתיים ללמינה פרופריה, קיצור קפלי הרירית וירידה בספיגת חומרים מזינים. היא מופיעה כאשר חלבון צמחי, במיוחד מקטע הסאפונין של קמח סויה, עולה על סבילות המין; סלמון אטלנטי מראה בדרך כלל סימנים מעל 15-20% של הכללת קמח סויה לא מטופל, ורגישות דומה מתרחשת בבס ובדניס. ההשלכות מדורגות ולא קטסטרופליות: ירידה בצריכת מזון ובגדילה, ספיגת חומרים מזינים ירודה המעלה את ה-FCR ב-0.1-0.3 יחידות, עמידות מופחתת למחלות, ובמקרים חמורים זיהומים משניים דרך המחסום הפגוע. אבחנה מבדלת חשובה מכיוון שדלקת מעיים חופפת לדלקת מעיים זיהומית מחיידקים כמו Aeromonas או גורמים ויראליים; היסטולוגיה של חתכי מעי אמצעי היא הכלי המאשר. הניהול משלב פתרונות עיבוד (קמח ממוצה בממס, קלוי היטב; תרכיז חלבון סויה, שהוא ברובו נטול דלקת מעיים), תוספים פונקציונליים (בוטיראט וחומצות אורגניות אחרות המזינות אנטרוציטים), ותקרות הכללה שנקבעו לפי מין. עבור מגדלים, הידרדרות בלתי מוסברת ב-FCR שבועות לאחר שינוי פורמולה היא הסימן הקלאסי בשטח לדלקת מעיים תת-קלינית.