एक्वापोनिक्स में हाइड्रोपोनिक पोषक तत्व अनुपूरण
एक अच्छी तरह से संतुलित एक्वापोनिक्स प्रणाली भी आमतौर पर व्यावसायिक रूप से प्रतिस्पर्धी विकास दरों पर केवल मछली अपशिष्ट से एक मांग वाली फसल को आवश्यक हर पोषक तत्व की आपूर्ति नहीं कर सकती है, क्योंकि मछली का चारा मछली की पोषण संबंधी आवश्यकताओं के लिए तैयार किया जाता है, न कि पौधों के लिए उपयुक्त पोषक तत्व प्रोफाइल को आकस्मिक रूप से वितरित करने के लिए अनुकूलित किया जाता है। इसका मतलब है कि पोटेशियम, कैल्शियम, लोहा और कुछ अन्य सूक्ष्म पोषक तत्व अक्सर उस मात्रा से कम पड़ जाते हैं जो गहन पादप उत्पादन को आदर्श रूप से प्राप्त होनी चाहिए, जिससे केवल मछली अपशिष्ट द्वारा प्रदान किए गए पोषक तत्व प्रोफाइल को स्वीकार करने के बजाय कमी को पूरा करने के लिए सीधे अनुपूरण की आवश्यकता होती है। एक युग्मित प्रणाली में अनुपूरण के विकल्प, जहाँ मछली और पौधे एक ही पानी साझा करते हैं, एक अकेले हाइड्रोपोनिक प्रणाली या एक डिकपल्ड एक्वापोनिक्स डिज़ाइन की तुलना में अधिक प्रतिबंधित होते हैं, क्योंकि उपयोग की गई सांद्रता पर कोई भी जोड़ा गया खनिज मछली के लिए सुरक्षित होना चाहिए। यह कुछ पारंपरिक हाइड्रोपोनिक पोषक तत्व लवणों को बाहर कर देता है जो केवल पौधों वाली प्रणाली में पूरी तरह से उपयुक्त होंगे लेकिन प्रभावी पादप-पोषक खुराक पर मछली के लिए संभावित रूप से हानिकारक हो सकते हैं। यही कारण है कि चेलेटेड लोहा और विशिष्ट मछली-सुरक्षित पोटेशियम और कैल्शियम स्रोत युग्मित प्रणालियों में मानक अनुपूरण विकल्प हैं, न कि सामान्य हाइड्रोपोनिक उर्वरक मिश्रण। डिकपल्ड प्रणालियाँ विशेष रूप से पादप-पक्षीय लूप पर इस बाधा का अधिकांश हिस्सा हटा देती हैं, क्योंकि वह पानी कभी मछली टैंक में वापस नहीं आता है, जिससे खुराक को सीमित करने वाले किसी भी मछली-सुरक्षा विचार के बिना अधिक आक्रामक, पारंपरिक-हाइड्रोपोनिक के करीब अनुपूरण की अनुमति मिलती है। यह डिकपल्ड डिज़ाइन द्वारा युग्मित प्रणाली पर प्रदान किए जाने वाले व्यावहारिक लाभों में से एक है जब पादप उपज को अधिकतम करना स्थापत्य सरलता बनाए रखने की तुलना में उच्च प्राथमिकता होती है। नियमित पत्ती ऊतक और जल पोषक तत्व परीक्षण, केवल दृश्य कमी के लक्षणों के अवलोकन के बजाय, उत्पादकों को उपज को स्पष्ट रूप से सीमित करने से पहले एक विकसित पोषक तत्व अंतर को पकड़ने और ठीक करने में मदद करता है, क्योंकि दृश्य कमी के लक्षण आमतौर पर तभी दिखाई देते हैं जब कमी पहले से ही कुछ समय से विकास को बाधित कर रही हो।