การกรองด้วยเยื่อเมมเบรน (UF/RO ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ)
การกรองด้วยเยื่อเมมเบรนในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำครอบคลุมถึงไมโครฟิลเตรชัน (MF, ขนาดรูพรุน 0.1–10 ไมโครเมตร), อัลตราฟิลเตรชัน (UF, 0.01–0.1 ไมโครเมตร) และรีเวิร์สออสโมซิส (RO, ซึ่งสามารถคัดแยกไอออนได้มากกว่า 98%) โดยแต่ละกระบวนการทำหน้าที่บำบัดในขั้นตอนที่แตกต่างกัน MF และ UF ใช้ขัดเกลาคุณภาพน้ำในระบบ RAS โดยการกำจัดแบคทีเรีย คอลลอยด์ขนาดเล็ก และอนุภาคขนาดเท่าไวรัสที่หลุดลอดจากถังกรองดรัมและตัวกรองวัสดุกรอง และเป็นหัวใจสำคัญของน้ำในระบบกักโรคและน้ำสำหรับพ่อแม่พันธุ์ที่ต้องการการกำจัดเชื้อโรคอย่างเด็ดขาด น้ำที่ผ่าน UF permeate มักจะถูกฆ่าเชื้อโรคจนลดจำนวนแบคทีเรียได้ 4–6 log ส่วน RO ใช้ผลิตน้ำเติม (make-up water) ที่มีคุณภาพตามกำหนดจากน้ำทะเลหรือน้ำกร่อย เพื่อควบคุมความเค็ม ความกระด้าง และสารปนเปื้อนที่ละลายอยู่ในโรงเพาะฟักสำหรับตัวอ่อนที่บอบบาง และช่วยให้ระบบบนบกสามารถตั้งอยู่ห่างจากแหล่งน้ำที่เหมาะสมได้ แรงดันในการทำงานอยู่ใกล้ระดับ 1–3 บาร์ สำหรับ UF และ 50–70 บาร์ สำหรับ RO น้ำทะเล โดยมีต้นทุนพลังงาน 2–4 กิโลวัตต์-ชั่วโมงต่อลูกบาศก์เมตรสำหรับ RO การลดลงของฟลักซ์เนื่องจากการอุดตัน (fouling) เป็นปัญหาการดำเนินงานหลัก ดังนั้นการบำบัดเบื้องต้นด้วยการกรองผ่านชั้นวัสดุกรองและไส้กรองแบบคาร์ทริดจ์ขนาด 5 ไมโครเมตรจึงเป็นมาตรฐาน และเยื่อเมมเบรนจำเป็นต้องทำความสะอาดในที่ (clean-in-place) ทุกสัปดาห์ด้วยสารละลายด่างและกรด อัตราส่วนการน้ำกลับมาใช้ใหม่ (recovery ratios) ที่ 50–75% หมายความว่าต้องมีการจัดการกำจัดกระแสน้ำเข้มข้น (concentrate stream) จำนวนมาก ต้นทุนค่าลงทุนและค่าดำเนินการทำให้ระบบเมมเบรนเต็มรูปแบบจำกัดอยู่เพียงในโรงเพาะฟัก พ่อแม่พันธุ์ และ RAS มูลค่าสูง แต่ราคาเมมเบรนที่ลดลงเรื่อย ๆ กำลังขยายขอบเขตการใช้งานไปสู่การนำน้ำกลับมาใช้ใหม่ในระบบเลี้ยงโตอย่างต่อเนื่อง