زراعة وعزل البكتيريا (مختبر التشخيص)
يعتمد التشخيص البكتيري القائم على الزراعة على تنمية عينة سريرية، مثل الدم، مسحة من آفة، أو نسيج عضو داخلي، على أوساط نمو انتقائية وتفاضلية مصممة لتشجيع نمو مسبب المرض المشتبه به مع قمع البكتيريا الخلفية المتنافسة، ثم عزل المستعمرات الفردية للتعرف عليها، وبشكل حاسم، لاختبار الحساسية للمضادات الحيوية الذي لا يمكن للطرق الجزيئية مثل qPCR توفيره، حيث يؤكد PCR الهوية الجينية لمسبب المرض ولكنه لا يخبرنا عن العلاجات التي سيستجيب لها الكائن الحي الفعلي. تستغرق هذه العملية وقتًا أطول بكثير من التشخيص القائم على PCR، عادةً 24-72 ساعة أو أكثر اعتمادًا على معدل نمو الكائن الحي، وهو العيب العملي الرئيسي الذي يقابل قدرتها الفريدة على إنتاج عزل حي لمزيد من التوصيف واختبار توجيه العلاج. اعتمد تحديد المستعمرة المعزولة تقليديًا على لوحات الاختبارات الكيميائية الحيوية (سلسلة من التفاعلات الأيضية التي تميز أجناس وأنواع البكتيريا) ولكنها تستخدم بشكل متزايد طرقًا سريعة مثل مطياف الكتلة MALDI-TOF أو التسلسل الجيني الجزئي للعزل لتأكيد الأنواع بشكل أسرع وأكثر دقة. لإدارة صحة الاستزراع المائي على وجه التحديد، تعتبر الزراعة المؤكدة مع نتائج حساسية المضادات الحيوية هي الأساس الذهبي لاختيار العلاج المناسب بدلاً من تطبيق مضاد حيوي واسع الطيف بناءً على الاشتباه السريري وحده، وهو تمييز يهم مباشرة في إدارة مقاومة مضادات الميكروبات.