วัฒนธรรม ชีวเคมี และ การ แยก ตัว (Dagnostic Lab)

การวินิจฉัยแบคทีเรียโดยใช้การเพาะเลี้ยงเติบโตตัวอย่างทางคลินิก เช่น เลือด แผ่นเชื้อจากแผล หรือเนื้อเยื่ออวัยวะภายใน บนอาหารเลี้ยงเชื้อแบบเลือกจำเพาะและแบบแตกต่าง ซึ่งถูกออกแบบมาเพื่อสนับสนุนการเจริญเติบโตของเชื้อที่สงสัยพร้อมกับยับยั้งแบคทีเรียพื้นหลังที่แข่งขัน จากนั้นจึงแยกอาณานิคมเดี่ยวสำหรับการระบุและที่สำคัญคือสำหรับการทดสอบความไวต่อยาปฏิชีวนะ ซึ่งวิธีทางโมเลกุลอย่าง qPCR ไม่สามารถให้ได้เนื่องจาก PCR ยืนยันเพียงตัวตนอัตลักษณ์ทางพันธุกรรมของเชื้อเท่านั้น แต่ไม่สามารถบอกได้ว่าการรักษาใดที่สิ่งมีชีวิตที่ยังมีชีวิตจะตอบสนองจริง กระบวนการนี้ใช้เวลานานกว่าการวินิจฉัยแบบ PCR อย่างมาก โดยทั่วไปอยู่ที่ 24-72 ชั่วโมงหรือมากกว่า ขึ้นอยู่กับอัตราการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ ซึ่งเป็นข้อเสียหลักในการปฏิบัติเมื่อเทียบกับความสามารถเฉพาะตัวในการผลิตเชื้อที่มีชีวิตเพื่อการระบุลักษณะเพิ่มเติมและการทดสอบเพื่อแนะนำการรักษา การระบุโคโลนีที่แยกออกมาแบบดั้งเดิมอาศัยแผงทดสอบทางชีวเคมี (ชุดของปฏิกิริยาการเผาผลาญที่ช่วยแยกความแตกต่างระหว่างสกุลและชนิดของแบคทีเรีย) แต่ในปัจจุบันมีการใช้วิธีที่รวดเร็วมากขึ้น เช่น การใช้มวลสเปกโตรมิเตอร์ MALDI-TOF หรือการทำลำดับพันธุกรรมบางส่วนของเชื้อที่แยกออกมาเพื่อยืนยันชนิดอย่างรวดเร็วและแม่นยำยิ่งขึ้น สำหรับการจัดการสุขภาพสัตว์น้ำโดยเฉพาะ การยืนยันการเพาะเลี้ยงที่มีผลการไวต่อยาปฏิชีวนะถือเป็นมาตรฐานทองคำสำหรับการเลือกการรักษาที่เหมาะสม แทนที่จะใช้ยาปฏิชีวนะแบบกว้างตามความสงสัยทางคลินิกเพียงอย่างเดียว ซึ่งความแตกต่างนี้มีความสำคัญโดยตรงต่อการดูแลความต้านทานต่อสารต้านจุลชีพ