معالجة مصدر المياه (الآبار، الأنهار، مياه البحر)
تعتبر معالجة المياه عند المدخل، قبل وصولها إلى الأسماك، خط الدفاع الأول والأرخص في الأمن البيولوجي وإدارة جودة المياه. عادة ما تكون مياه الآبار خالية من مسببات الأمراض ولكنها غالبًا ما تحتوي على مستويات عالية من ثاني أكسيد الكربون المذاب (10-50 mg/L)، والحديد، والمنغنيز، ومستويات منخفضة من الأكسجين المذاب؛ تعتبر شلالات إزالة الغازات بالإضافة إلى التهوية وترشيح رمل المنجنيز لخفض الحديد إلى أقل من 0.3 mg/L إجراءات قياسية، مع استخدام الأوزون أو الأشعة فوق البنفسجية أحيانًا لأي خطر تسرب سطحي. تطرح مياه الأنهار والبحيرات مشكلة معاكسة: فهي غنية بالمواد الصلبة العالقة (10-500 mg/L موسميًا)، والطحالب، ومسببات الأمراض للأسماك البرية، والمخلفات الزراعية؛ تتضمن المعالجة النموذجية الفرز الخشن، التخثير والتلبيد، الترسيب أو التعويم بالهواء المذاب، الترشيح الرملي السريع، ثم الأشعة فوق البنفسجية 30-60 mJ/cm²، مع فحص المستويات المتبقية باستمرار. تركز معالجة مياه البحر عند المدخل على الترشيح لحماية المضخات والمرشحات الحيوية، والتحكم في التلوث البيولوجي الكبير، وفي المفرخات الحساسة، أغشية الترشيح الفائق (UF) أو ترشيح الخرطوشة 1 µm بالإضافة إلى الأشعة فوق البنفسجية لاستبعاد يرقات الطفيليات والبكتيريا. قد تحتاج المياه الجوفية عالية العسر إلى تليين أو جرعات حمضية للحفاظ على pH والقلوية ضمن النطاقات المستهدفة. يجب أن يجيب كل تصميم للمدخل على ثلاثة أسئلة: ما هي الكائنات الحية والمواد الكيميائية التي يحملها المصدر في أسوأ الظروف (الفيضان، ازدهار الطحالب)، ما هي خطوات المعالجة التي تزيلها، وكيف يتم حماية المزرعة إذا فشلت المعالجة، ويفضل أن يكون ذلك بخزان مياه خام بحجم يكفي ليوم إلى يومين وصمامات تحويل آلية.