रोगजनक
रोगजनक कोई भी सूक्ष्मजीव या परजीवी है जो मेजबान में बीमारी पैदा करने में सक्षम है। जलीय कृषि में, यह अनिवार्य घातक विषाणुओं (जो अच्छी तरह से प्रबंधित, तनाव-मुक्त स्टॉक को भी तबाह कर सकते हैं) से लेकर अवसरवादी बैक्टीरिया जैसे एयरोमोनास, विब्रियो और स्यूडोमोनास तक फैला हुआ है, जो सामान्यतः हानिरहित स्तरों पर मौजूद होते हैं और केवल तभी बीमारी पैदा करते हैं जब मेजबान की प्रतिरक्षा कमजोर हो जाती है। बीमारी वास्तव में होती है या नहीं, यह रोगजनक भार, मेजबान की संवेदनशीलता और पर्यावरणीय परिस्थितियों के परस्पर क्रिया का परिणाम है - जिसे शास्त्रीय महामारी विज्ञान त्रय कहा जाता है - यही कारण है कि जलीय कृषि में प्रकोप आमतौर पर पानी की गुणवत्ता, घनत्व या प्रबंधन की विफलता का एक दृश्य लक्षण होता है, न कि कोई आकस्मिक दुर्भाग्य। भीड़भाड़, हाइपोक्सिया, अमोनिया के संपर्क में आना, तेजी से तापमान परिवर्तन और प्रबंधन सहित तनाव कारक सभी कोर्टिसोल को बढ़ाते हैं और प्रतिरक्षा कार्य को दबाते हैं, जिससे संतुलन उन जीवों की ओर झुक जाता है जिनका मछली अन्यथा प्रतिरोध करती। रोगजनक पानी, दूषित उपकरण, जीवित भोजन और खेतों के बीच स्टॉक की आवाजाही के माध्यम से फैलते हैं, यही कारण है कि संगरोध (quarantine), कीटाणुशोधन (disinfection) और ऑल-इन-ऑल-आउट बैच प्रबंधन उद्योग के मुख्य जैव-सुरक्षा उपकरण हैं। आधुनिक निगरानी आणविक निदान पर निर्भर करती है - qPCR और RT-PCR परीक्षण जो बहुत कम सांद्रता पर रोगजनक DNA या RNA का पता लगाते हैं - जिससे नैदानिक रोग प्रकट होने से पहले स्पष्ट रूप से स्वस्थ ब्रूडस्टॉक और SPF जैसे प्रमाणन कार्यक्रमों में प्रारंभिक पहचान संभव हो पाती है।
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