ゲノム育種価 (GEBV) および ssGBLUP

ゲノム育種価（GEBV）は、個体自身の高密度遺伝子マーカープロファイルと、より大規模な近縁個体の参照集団からの形質およびマーカーデータを組み合わせることで、その個体の特定の形質に対する遺伝的価値を予測します。これにより、血統情報と表現型記録のみに基づく予測よりも格段に正確な予測が得られます。特に、病気への抵抗性や肉質のように、動物を犠牲にするか病原体に曝露させなければ測定できない形質において価値があります。これは、実際の育種候補動物自体はその特定の形質について直接表現型を測定できないものの、そのゲノムプロファイルによって、測定された近縁個体における特定の遺伝子マーカーの性能に基づいて、その動物の遺伝的価値を推定できることを意味します。シングルステップゲノムBLUP（ssGBLUP）は、ゲノムマーカーデータ、血統関係データ、および表現型記録を単一の解析ステップで統合された予測モデルに組み合わせる現在標準的な統計手法であり、これらの異なるデータソースを効率的に統合できず、情報損失やステップ間の不整合が生じやすかった古い多段階アプローチに取って代わりました。予測精度は、モデルの較正に使用される参照集団の規模と関連性に大きく依存します。ゲノム予測は、遺伝子マーカーと実際の形質結果を結びつける基礎となる訓練データがどれだけ代表的で大規模であるかにかかっているためです。したがって、育種プログラムは、プログラムの初期に一度確立された静的な参照集団に依存するのではなく、連続する育種サイクルを通じて予測精度を維持および向上させるために、各新世代の表現型および遺伝子型データで参照集団を継続的に更新および拡張します。血統に基づく育種価のみではなく、GEBVに基づいて育種候補を選抜することで、いくつかの主要な水産養殖育種プログラムにおいて遺伝的改良速度が著しく加速されています。ゲノム情報により、育種家は動物の生涯の早い段階で、完全な表現型性能が観察可能になる前に、より正確な選抜決定を下すことができ、特定のレベルの遺伝的改良を達成するために必要な世代間隔を短縮できるためです。