การแบ่งเขตบ่อและโครงสร้างความลึก
การแบ่งเขตบ่อและโครงสร้างความลึกหมายถึงวิธีการปรับแต่งก้นบ่อให้เป็นเขตใช้งานต่างๆ (เช่น พื้นที่หลบภัยน้ำลึก เขตให้อาหารหรือจุดระบายน้ำ และไหล่บ่อตื้น) รวมถึงการกำหนดความลึกเฉลี่ยและความลึกสูงสุดให้เหมาะสมกับสัตว์น้ำเป้าหมายและความหนาแน่นในการเลี้ยง บ่อปลาแบบกึ่งพัฒนาทั่วไปจะมีความลึก 1.2-1.8 เมตร บ่อกุ้งแบบหนาแน่นมีความลึก 1.0-1.5 เมตร และบ่อเลี้ยงแบบธรรมชาติอาจตื้นกว่าที่ 0.8-1.2 เมตร บ่อที่ลึกกว่าจะช่วยรักษาระดับอุณหภูมิและปริมาตรน้ำให้คงที่มากกว่า แต่ยากต่อการผสมน้ำและอาจเกิดชั้นน้ำแยกตัว บ่อพักหรือหลุมระบายน้ำที่มุมบ่อช่วยกักเก็บของเสียและทำให้สามารถระบายน้ำได้หมดในขณะจับสัตว์น้ำ ขณะที่ไหล่บ่อตื้นในบ่อกุ้งช่วยให้เกษตรกรตรวจสอบยออาหารและให้กุ้งเข้าถึงอาหารได้ง่าย โครงสร้างความลึกมีความสัมพันธ์กับการแบ่งชั้นอุณหภูมิน้ำ: ในช่วงที่ลมสงบ ผิวน้ำจะมีอุณหภูมิสูงกว่าน้ำก้นบ่อ และหากไม่มีการผสมน้ำ ก้นบ่อจะกลายเป็นเขตไร้อากาศ (anaerobic) บ่อตื้นที่มีความลึกสม่ำเสมอจะผสมน้ำได้ง่ายกว่าด้วยลมและเครื่องเติมอากาศเพียงเครื่องเดียว ในแง่ของการออกแบบ ความลึกที่สม่ำเสมอช่วยให้การก่อสร้างและการเติมอากาศง่ายขึ้นแต่ไม่สูญเสียพื้นที่ ในขณะที่บ่อที่มีการแบ่งเขตต้องอาศัยการปรับระดับที่แม่นยำแต่ช่วยลดแรงงานในการจับสัตว์น้ำและปัญหาตะกอน การแบ่งเขตที่ถูกต้องยังมีความสำคัญต่อการควบคุมสัตว์นักล่า การป้องกันนก และการใช้ลอบอวนจับปลา การออกแบบโครงสร้างความลึกให้ถูกต้องตั้งแต่เริ่มก่อสร้างมีต้นทุนที่ถูกกว่าการมาแก้ไขภายหลังมาก และเป็นรากฐานของการตัดสินใจในภายหลังเกี่ยวกับตำแหน่งการเติมอากาศ การเปลี่ยนถ่ายน้ำ และวิธีการจับสัตว์น้ำ