কিউপিসিআর রোগজীবাণু রোগনির্ণয়

কোয়ান্টিটেটিভ পিসিআর (qPCR) বারবার এনজাইমেটিক রেপ্লিকেশন চক্রের মাধ্যমে DNA বা RNA-এর একটি সংক্ষিপ্ত, রোগজীবাণু-নির্দিষ্ট অংশকে বিবর্ধিত করে এবং একই সাথে রিয়েল টাইমে ফ্লুরোসেন্ট সংকেত পরিমাপ করে, যা রোগজীবাণুর উপস্থিতি নিশ্চিত করে এবং সনাক্তকরণ থ্রেশহোল্ড অতিক্রম করতে কতগুলো বিবর্ধন চক্র প্রয়োজন হয়েছে তার ভিত্তিতে নমুনায় এর আপেক্ষিক পরিমাণ অনুমান করে, কম চক্র মানে প্রাথমিক রোগজীবাণুর লোড বেশি। গতি (কালচার-ভিত্তিক ব্যাকটেরিয়া নির্ণয়ে প্রয়োজনীয় দিনের পরিবর্তে ঘণ্টায় ফলাফল), উচ্চ সংবেদনশীলতা (দৃশ্যমান ক্লিনিকাল লক্ষণ সৃষ্টিকারী মাত্রার চেয়ে অনেক কম সংক্রমণ লোড সনাক্ত করতে সক্ষম) এবং পরিমাণ নির্ধারণের এই সমন্বয় qPCR-কে চিংড়ির WSSV এবং বেশ কয়েকটি তালিকাভুক্ত ফিনফিশ ভাইরাসের মতো ভাইরাল রোগজীবাণুর জন্য প্রধান সম্মুখ সারির ডায়াগনস্টিক পদ্ধতিতে পরিণত করেছে, যা প্রচলিত পরীক্ষাগার পদ্ধতিতে কালচার করা কঠিন বা অসম্ভব। ডায়াগনস্টিক পরিষেবার ক্রেতাদের বোঝা উচিত এমন একটি গুরুত্বপূর্ণ সীমাবদ্ধতা হলো qPCR জেনেটিক উপাদান সনাক্ত করে, অগত্যা জীবিত, সংক্রামক জীব নয়, তাই মৃত বা পূর্বে সংক্রমিত ও পরে মুক্ত প্রাণীর নমুনায়, অথবা নমুনার পরিবেশগত DNA দূষণ থেকে প্রাপ্ত পজিটিভ ফলাফলের জন্য কাঁচা পরীক্ষার ফলাফলকে সক্রিয় রোগের স্বয়ংক্রিয় প্রমাণ হিসাবে বিবেচনা না করে ক্লিনিকাল ও মহামারী সংক্রান্ত ব্যাখ্যা প্রয়োজন। প্রাইমার এবং প্রোব ডিজাইনের নির্দিষ্টতা নির্ধারণ করে যে পরীক্ষাটি নির্ভরযোগ্যভাবে লক্ষ্য রোগজীবাণুকে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত, অ-রোগজীবাণু জীব থেকে পৃথক করতে পারে কিনা, যে কারণে নামযুক্ত তালিকাভুক্ত রোগের জন্য বৈধ, প্রকাশিত প্রাইমার সেটগুলো অচিহ্নিত ইন-হাউস অ্যাসের চেয়ে বেশি ডায়াগনস্টিক গুরুত্ব বহন করে।

কিউপিসিআর রোগজীবাণু রোগনির্ণয়
ছবি: Petty Officer 2nd Class Justin Webb / Wikimedia Commons, Public domain

সম্বন্ধীয় শর্তাবলী