मृत शरीर और मृत्यु निपटान प्रोटोकॉल
मृत्यु निपटान प्रोटोकॉल यह नियंत्रित करते हैं कि मृत स्टॉक को कैसे एकत्र किया जाता है, संभाला जाता है और निपटाया जाता है ताकि वह स्वयं जैव-सुरक्षा या पर्यावरणीय खतरा न बने, क्योंकि एक संस्कृति प्रणाली में या उसके पास छोड़ा गया एक विघटित मृत शरीर जल गुणवत्ता क्षरण (ऑक्सीजन की मांग, अमोनिया का उत्सर्जन) का एक सीधा स्रोत है और, यदि मृत्यु रोग-संबंधी थी, तो रोगजनक का एक केंद्रित भंडार है जो शेष जीवित आबादी को फिर से संक्रमित कर सकता है यदि इसे तुरंत हटाया और सही ढंग से संभाला न जाए। स्वीकृत निपटान विधियाँ पैमाने और नियामक क्षेत्राधिकार के अनुसार भिन्न होती हैं, लेकिन आमतौर पर इसमें मछली के भोजन या अन्य उपोत्पाद धाराओं में प्रसंस्करण (केवल तभी जब मृत्यु का कारण इसे रोकता न हो और नियम इसकी अनुमति दें), नियंत्रित परिस्थितियों में खाद बनाना जो अधिकांश रोगजनकों को निष्क्रिय करने के लिए पर्याप्त गर्मी उत्पन्न करती है, उच्च जोखिम वाले रोग की घटनाओं के लिए भस्मीकरण, और लाइसेंस प्राप्त दफन या लैंडफिल निपटान शामिल हैं, जिनमें से प्रत्येक को मृत्यु की मात्रा, संदिग्ध कारण और स्थानीय पर्यावरणीय विनियमन के आधार पर चुना जाता है। एक पुष्ट रोग प्रकोप के दौरान, निपटान प्रोटोकॉल आमतौर पर उपलब्ध सबसे रोगजनक-विनाशकारी विधि (खाद बनाने के बजाय भस्मीकरण या उच्च तापमान प्रसंस्करण) तक बढ़ जाते हैं, विशेष रूप से इसलिए क्योंकि पृष्ठभूमि मृत्यु दर के लिए पर्याप्त नियमित निपटान विधियाँ महामारी-उत्पन्न करने वाले रोगजनक को मज़बूती से निष्क्रिय नहीं कर सकती हैं। दैनिक मृत्यु दर संग्रह की आवृत्ति निपटान विधि जितनी ही महत्वपूर्ण है, क्योंकि दिनों तक प्रणाली में छोड़े गए मृत शरीरों पर लागू की गई एक सही निपटान विधि ने भी जल गुणवत्ता क्षरण और रोगजनक प्रवर्धन की अनुमति दे दी है जिसे त्वरित हटाने से रोका जा सकता था।