Épigénétique en sélection aquacole
L'épigénétique étudie les changements héréditaires dans l'expression des gènes, c'est-à-dire quels gènes sont activement activés ou désactivés, qui se produisent sans aucune modification de la séquence d'ADN sous-jacente elle-même. Ces changements sont plutôt induits par des modifications chimiques de l'ADN et de ses protéines associées, qui peuvent être influencées par les conditions environnementales qu'un animal subit, en particulier pendant les premiers stades de développement, et dans certains cas documentés peuvent même être partiellement transmis aux générations suivantes. Il s'agit d'une couche d'héritage biologique distincte et additionnelle à l'héritage génétique direct sur lequel reposent l'estimation conventionnelle de la valeur génétique et la sélection génomique. Les effets épigénétiques documentés pertinents pour l'aquaculture incluent la température et d'autres conditions environnementales subies pendant le développement larvaire ou embryonnaire précoce, influençant les performances de croissance ultérieures, la résilience au stress et, chez certaines espèces, les résultats de la détermination du sexe. Ces découvertes ont des implications pratiques pour les protocoles de gestion des écloseries et des nurseries, car les conditions d'élevage au stade précoce peuvent avoir des conséquences durables sur les performances au-delà de leur effet immédiat et directement observable pendant cette fenêtre de développement spécifique. Ce domaine de recherche reste considérablement moins mature et moins directement exploitable pour la prise de décision en matière de sélection commerciale que les outils de sélection génomique établis, car la mesure et la prédiction fiables des effets épigénétiques, et plus important encore l'évaluation de leur héritabilité et de leur cohérence à travers les générations, sont scientifiquement plus complexes que la prédiction basée sur des marqueurs génétiques. Cela signifie que la plupart des recherches actuelles en épigénétique en aquaculture sont encore principalement exploratoires plutôt que de fournir aux programmes de sélection des outils de sélection épigénétique matures et directement déployables, comparables à l'application commerciale établie de la sélection génomique. Les applications pratiques futures potentielles activement recherchées incluent l'utilisation de marqueurs épigénétiques comme biomarqueurs précoces prédisant les performances ultérieures ou la résilience au stress avant que ces résultats ne soient autrement observables, et la gestion délibérée des conditions environnementales d'élevage précoce spécifiquement pour induire une programmation épigénétique bénéfique, une approche parfois appelée programmation développementale, qui, si elle est validée, pourrait offrir un complément non génétique aux stratégies conventionnelles d'amélioration génétique.
