qPCR रोगजनक निदान

क्वांटिटेटिव पीसीआर (qPCR) डीएनए या आरएनए के एक छोटे, रोगजनक-विशिष्ट खंड को दोहराए गए एंजाइमी प्रतिकृति चक्रों के माध्यम से प्रवर्धित करता है, जबकि वास्तविक समय में प्रतिदीप्ति संकेत को मापता है। यह रोगजनक की उपस्थिति की पुष्टि करता है और नमूने में उसकी सापेक्ष मात्रा का अनुमान लगाता है कि पता लगाने की सीमा को पार करने के लिए कितने प्रवर्धन चक्रों की आवश्यकता थी; कम चक्रों का अर्थ है उच्च प्रारंभिक रोगजनक भार। गति (कल्चर-आधारित जीवाणु निदान के लिए आवश्यक दिनों के बजाय घंटों में परिणाम), उच्च संवेदनशीलता (दृश्य नैदानिक ​​संकेतों का कारण बनने वाले स्तर से काफी नीचे संक्रमण भार का पता लगाने में सक्षम), और मात्रा निर्धारण के इस संयोजन ने qPCR को वायरल रोगजनकों जैसे झींगा में WSSV और कई अधिसूचित फिनफिश वायरस के लिए प्रमुख अग्रिम पंक्ति निदान विधि बना दिया है, जिन्हें पारंपरिक प्रयोगशाला विधियों द्वारा कल्चर करना मुश्किल या असंभव है। नैदानिक ​​सेवाओं के खरीदारों को यह समझना चाहिए कि एक महत्वपूर्ण सीमा यह है कि qPCR आनुवंशिक सामग्री का पता लगाता है, जरूरी नहीं कि एक जीवित, संक्रामक जीव का। इसलिए, एक मृत या पहले से उजागर और ठीक हुए जानवर पर, या नमूने के पर्यावरणीय डीएनए संदूषण से प्राप्त सकारात्मक परिणाम के लिए कच्चे परीक्षण परिणाम के साथ नैदानिक ​​और महामारी विज्ञान संबंधी व्याख्या की आवश्यकता होती है, बजाय इसके कि किसी भी सकारात्मक परिणाम को सक्रिय रोग का स्वचालित प्रमाण माना जाए। प्राइमर और प्रोब डिज़ाइन की विशिष्टता यह निर्धारित करती है कि कोई परीक्षण लक्षित रोगजनक को निकट संबंधी, गैर-रोगजनक जीवों से विश्वसनीय रूप से अलग करता है या नहीं, यही कारण है कि नामित अधिसूचित रोगों के लिए मान्य, प्रकाशित प्राइमर सेट एक अज्ञात इन-हाउस परख की तुलना में अधिक नैदानिक ​​महत्व रखते हैं।